传统的手工菌落计数器由于使用环境和检测流程，难免在计数仓部分对设备产生污染。由于手动价格低廉，往往难以拆卸或者清洁。部分国产厂家号称可以放进灭菌设备中高温高压灭菌，殊不知这种灭菌方式对于设备的电子和机械结构伤害*
早期的菌落计数器，也没考虑到交叉污染的问题，而且，由于早期功能限制，对于复杂生长情况的平皿，尤其是部分在盖子上写字的平皿，更是会对识别造成干扰，不打开盖子就没有办法进行计数，不仅没有起到简化检验流程，提高检验自动化程度的作用，反而加长了检验时间，甚至对检验人员的安全健康造成了潜在威胁。
计数器除了不断提升Autocount智能识别技术的识别效果，使检验人员不用打开盖子就能排除字迹和杂质的干扰。还采用了可以替换的样品仓和暗仓结构，只需要简单的步骤即可对有可能收到污染的样品仓部分进行拆卸和替换，替换下来的组件可以进行清洁和消毒处理，作为下次替换的备用组件。
另外可以选配UV组件，通过不同的波长，实现对显色培养基的荧光观察，也可通过UV方法直接对仓内进行灭菌。
准确快速的一键识别功能。常规菌落计数仅需直接点击“识别”，一键可完成识别区域的判定，杂质的剔除，菌落数量的识别，对全平皿的计数分析仅需3秒。统一了识别标准、降低工作强度、提高检验效率，同时数据准确性和复现性也比常规计数有显著提高。
