随着人们环保的关注，其中高校、科研机构、检测机构和企业中的检验研究部门中的医学实验室废水由于越来越多，不但给水资源造成极大的污染，同时也破坏了生态的平衡，所以废水的处理问题成为人们期盼的需要解决的重要问题。
废水处理的整个过程为通过粗格删的原废水经过废水提升泵提升后，经过格删或者筛率器，之后进入沉砂池，经过砂水分离的废水进入初次沉淀池，以上为一级处理(即物理处理)，初沉池的出水进入生物处理设备，有活性污泥法和生物膜法，(其中活性污泥法的反应器有曝气池，氧化沟等，生物膜法包括生物滤池、生物转盘、生物接触氧化法和生物流化床)，生物处理设备的出水进入二次沉淀池，二沉池的出水经过消毒排放或者进入三级处理，一级处理结束到此为二级处理，三级处理包括生物脱氮除磷法，混凝沉淀法，砂滤法，活性炭吸附法，离子交换法和电渗析法。二沉池的污泥一部分回流至初次沉淀池或者生物处理设备，一部分进入污泥浓缩池，之后进入污泥消化池，经过脱水和干燥设备后，污泥被后利用。
医学实验废水主要来源
实验室废水来源于教学实验废水、科研实验废水，以及实验室各项 卫生用水和办公生活用水使用后的外排废水 。教学实验废水和科研实验室废水均指以医学专业技能教学和医学研究方向为目的的各项实验过程中产生的废水，由于各个实验室和各个实验人员从事的实验项目不尽相同，同一实验人员的实验内容也常常更换，因此各类实验废水的排放总量一般较少，但随时间的变化较大，其排放是不连续的，其浓度是多变的，其成分是复杂的 ，对人和环境的危害性又是多样的。而实验室各项卫生洗涤废水中的污染物含量也因教学实验废 水和科研实验废水的不同而成分复杂，但相对的污染物浓度较低。实验室办公生活废水污染物较为简单，这部分以COD、BOD和悬浮物为主。
实验室的废水是在试验操作过程，各种器皿、仪表、工具、衣服的洗涤及设备有冷却等而产生的，这些废水应按其性质、成分等采取不同的处理方式。有的废水可以回收利用其中有用的物质、有的可以直 接至外部排水管网、有的则采用适当的方法处理后，然后再排至外部管网。例如：一般设备冷却经使用后仅水温有所升高，这类废水不经处理就可排入水体或外部捧水管网，有的经简单 处理还可重复使用。对于含酸或碱类物质的废液，如浓度较大时，可利用废酸或废碱相互中和，再用 pH试纸检验，若废液的pH值在5.8～8.6之间。对于实验中产生的废液，则需回收后交付有处理资质的单位处理。废水经实验室处理和回收后，因清洗器皿而带入排水系统的极少量的污染物，应经学校废水处理站处理后，符合 国家规定的排放标准，才可排入水体或外部排放管网。
在我国生产废水未经处理直接排放怎么处罚，一般来说达不到“污水综合排放标准”的应该得到的处罚，具体参照的相关法律法规情况如下：
《中华人民共和国水污染防治法》，2008年6月1日起施行。
第七十四条 违反本法规定，排放水污染物超过国家或者地方规定的水污染物排放标准，或者超过重点水污染物排放总量控制指标的，由县级以上人民环境保护主管部门按照权限责令限期治理，处应缴纳排污费数额二倍以上五倍以下的罚款。
限期治理期间，由环境保护主管部门责令限制生产、限制排放或者停产整治。限期治理的期限长不超过一年;逾期未完成治理任务的，报经有批准权的批准，责令关闭。
