有两种基本几何形状的UASB反应器：即矩形和圆形。这两种类型的反应器都已大量应用于实际中。
圆形反应器具有结构较稳定的点，同时对于圆形反应器在同样的面积下，其周长比正方形的少12。所以圆形池子的建造费用比具有相同面积的矩形反应器少要12。但是圆形反应器的这一点仅仅在采用单个池子时才成立，所以，单个或小的反应器可以建造成圆形的。
而大的反应器经常建成矩形的或方形的。当建立两个或两个以上反应器时，矩形反应器可以采用共用壁。当建造多个矩形反应器时有其性。对于采用公共壁的矩形反应器，池型的长宽比对造价也有较大的影响。对于UASB反应器建造多个池子的系统是有益的，这可以增加处理系统的适应能力。如果有多个反应池的系统，则可能关闭一个进行维护和修理，而其他单元的反应器继续运行。
混凝土结构的UASB反应器是为常见的结构和材料型式，但是采用化和系列化的考虑结构的通用性和简单性，在此基础上形成的系列化才能有生命力和的。
厌氧反应器三相分离器三相分离器是厌氧反应器的核心装置，主要应用于UASB、EGSB、IC等厌氧反应器中，它在厌氧反应中可实现固、液、气三相分离。因三相分离的效果直接决定了厌氧工艺的成败，所以三相分离器的设计参数要严谨，性能良好的三相分离器是UASB、EGSB、IC反应器高负荷、稳定良好运行的保证。
厌氧反应器三相分离器随着污水与污泥相接触而发生厌氧反应，产生沼气（气体是甲烷和二氧化碳）引起污泥床扰动。在污泥床产生的气体中有一部分附着在污泥颗粒上，自由气泡和附着在污泥颗粒上的气泡上升至反应器的顶部。污泥颗粒上升撞击到脱气挡板的底部，这引起附着的气泡释放；脱气的污泥颗粒沉淀回到污泥床的表面。自由气体和从污泥颗粒释放的气体被收集在反应器顶部的集气室内。液体中包含一些剩余的固体和生物颗粒进入到沉淀室内，剩余固体和生物颗粒从液体中分离并通过反射板落回到污泥层的上面。分离气体、固体后的液体继续上升，从出水堰溢流，经集水槽排出。沼气聚集于三相分离器顶部，通过气管排出。高浓度有机生产废水经过厌氧反应器预处理后，有机物得到大量去除，COD大幅度下降。
