毛细管电泳技术及应用：
毛细管电泳技术具有高效、快速、成本低、应用模式多等显著优势，因此被广泛地应用于生物、化学、医药行业的科学研究及工业生产中。毛细管电泳技术的分离范围覆盖了从离子、化合物等小分子，到蛋白、核酸、糖类等大分子甚至细胞和病毒等。尤其在离子、碱性药物、蛋白等极性化合物的分离中，更显示出特别的优势。毛细管电泳技术正在逐渐替代传统平板凝胶电泳技术，弥补了高压液相色谱技术的不足、成为高效液相色谱的有力补充。毛细管电泳技术与其它技术如激光诱导荧光检测技术、免疫分析技术、多级串联质谱、电化学检测技术等的联用也日趋活跃。
（1） 环境、食品和工业中的离子分析
与离子色谱技术相比，毛细管电泳技术应用于阴阳离子的分离，具有速度快、效率高、对样品的抗*力强等特点。因此特别适合于复杂样品，如电镀工业、环境废水、食品饮料中阴阳离子及有机酸的定量分析。
（2） 手性药物的拆分
大部分的天然产物及合成药物都属于手性对映体，因此手性药物拆分及纯度分析是药物生产的重要环节。将高磺化环糊精等手性拆分剂添加到电泳缓冲液中，可以实现大部分手性对映体的快速分离和定量。由于毛细管电泳方法分离效率高、速度快、成本低，已被药典收录，在众多制药公司中用于手性药物的纯度检测。
（3） PTA工业杂质测定
毛细管电泳方法分离效率高、抗*力强、成本低、简单快速，已经成为工业用粗、精对苯二甲酸（PTA）纯度检测的标准方法，对其中的对羧基苯甲醛（4-CBA）和对甲基苯甲酸（p-Tol）等杂质进行高灵敏的定量检测。
参见中华人民共和国石油化工行业标准：工业用精对苯二甲酸（PTA）中对羧基苯甲醛（4-CBA）和对甲基苯甲酸（p-Tol）含量的测定（SH/T 1687-2000）。
（4） 核酸的分离分析
目前核酸分析及基因分析大都采用毛细管电泳的方法，这是因为毛细管电泳与传统的平板凝胶电泳相比具有高分辨率、高速度、高自动化的优势。毛细管电泳可以对单链、双链核酸进行片段分离和定性定量检测。用于反义核酸药物、引物的质量控制；PCR产物及其他dsDNA的纯度分析；基因疫苗的成分分析；蛋白质-DNA相互作用测定以及核酸适配体的筛选。结合激光诱导荧光检测器和染料嵌合，可以直接对各种核酸进行高灵敏度的快速分离检测。
