随着微生物快速检测法的不断发展，很多检验技术日趋成熟和完善，并被人们进一步开发研制成自动或半自动微生物检测仪。全自动微生物分析系统。该装置的zui大特点在于同微生物检测应用的传统方法有着明显的变革，它无须经过微生物分离培养和纯化过程，就能直接从样品检出特殊的微生物种类和菌群来。能同时进行60个～200个样品的分析，速度快、易操作、结果准确，适用于各类细菌的检验和鉴定。
另外，免疫诊断检测系统是一种从混合细菌或细胞中分离和分析细胞、微生物或细胞个体类型的自动化仪器，近年已被用于DNA含量、染色体组成及细胞表面标记等物质的测定。MClelland R D和Dinder A C用该仪器结合单克隆抗体检测食品中的沙门氏菌，灵敏度达到0.1c f u／g 。
蛋白质指纹图谱技术是随着蛋白质组学兴起的一种新技术，用于各种疾病特异性蛋白指纹的识别和判断，可以直接检测不经处理的尿液、血液或细胞裂解液等。人体血清里有成千上万个蛋白，人一旦发生了某种疾病，蛋白质成分就必然会起变化。研究员利用“蛋白质质谱指纹图谱”技术及其检测办法，可以分析得出SARS与非SAR S病人血清中的蛋白质成分变化。该技术不是利用单独的蛋白质峰的出现和消失来判断SARS，而是用5个蛋白质峰的出现和消失来判断，好比刑侦破案中甄别5个手指的指纹， 故此称为“指纹图谱”。
质谱仪通过复杂的计算能够记住S A R S 病人血清里蛋白质的图谱， 通过对质谱仪的“训练”之后，它就能够根据人体血清中的特异变化，灵敏地辨别出测试的对象是否感染了S AR S病毒。这种检测方法阳性率接近9 5％， 特异性将近9 6％，能在病人发烧的*天即可以得出满意的检测结果。只需要一滴血，将采集到的病人血样现场直接放到9m o l／L的尿素里，病毒可以迅速溶解灭活，这样在一般医院的化验室里即可实现安全操作，从而防止交叉感染。有专家称蛋白质指纹图谱技术标志着一种划时代的诊断模式的诞生。
