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基因检测发现意义不明的变异

阅读:638发布时间:2015-7-31

研究所的研究人员在会上表示,在利用新一代测序的基因检测集合来筛查患者时,他们发现了一些意义不明的变异。

研究人员筛查了12名妇女,她们缺乏BRCA1BRCA2突变,但有着其他的乳腺癌相关突变。研究人员发现,其中8名妇女带有意义不明的变异。之后,她们再次研究了这些变异的意义,发现一些能够被归为良性,而另一些是可能有害的。

乳腺癌是*妇女的*杀手,大约有5-10%的癌症是遗传的。尽管BRCA1BRCA2突变占了遗传性乳腺癌病例的近半数,但是其他基因的变异也与疾病风险相关,这就给诊断带来了挑战。

除了开发BRCA1BRCA2的基因检测,研究人员还开发了一种名为Breast Cancer Panel 2BCP2)的检测,针对15个基因中的变异,包括ATMCHEK2PTENRAD50TP53

研究人员利用BCP212名缺乏BRCA1BRCA2突变的妇女进行筛查。她们从每名患者的外周血样本中提取DNA,并在Thermo Fisher Ion PGM测序仪上进行测序,之后通过Sanger测序来验证。根据获得的报告,她们在文献中搜索那些结果可能意味着什么。

研究人员表示,报告可能是三种结果中的一种:阳性结果,发现已知的致病变异;发现VUS;阴性结果,未发现任何已知的致病变异或VUS。不过,她指出,阴性结果也不一定是结论性的,因为妇女可能在她们未检测的基因中带有突变。

在这项研究中,研究人员无法在4名患者的样本中上找到临床突变,而在另外8名患者中,她们发现了一个或多个基因带有临床意义不明的变异。其中,4名患者是ATM基因有VUS,而3名患者是PALB2基因有VUSTorrezan表示,许多VUS是新生错义突变或次要等位基因频率低的错义突变。

不过,研究人员补充道,一些VUS的状态已经改变。在她准备演讲稿时,再次进行数据库的搜索,发现PALB2CHEK2中的VUS已经被分别归类为良性和危害性。她认为,这也强调了计算机分析工具的重要性,必须保持数据库更新,并开展不同变异的功能研究,才能了解它们的意义。


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