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上海沪宇生物科技有限公司
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阅读:319发布时间:2015-8-18
研究介绍了再生障碍性贫血的突变和克隆动态模式。这是由多种原因引起的造血障碍,有时会发展成骨髓增生异常综合征或急性髓系白血病。
研究小组综合利用外显子组测序、靶向测序和基于芯片的核型分析,研究了400多名患者血液样本的体细胞突变图谱。通过这些数据,研究人员在近一半的样本中发现造血细胞克隆的扩增。在约三分之一的病例中,他们检测到与骨髓增生异常综合征和/或AML相关的基因突变。
骨髓移植和免疫抑制疗法已经成功治疗甚至*了许多再生障碍性贫血的病例。然而,大约有15%的患者仍然会发展成骨髓增生异常综合征或急性髓系白血病,这个过程似乎涉及到某些含有突变的克隆的进化和扩增。此外,一些含有体细胞突变的造血干细胞克隆的扩增也会导致其他疾病,如阵发性睡眠性血红蛋白尿症。
为了区分开这些不同疾病的克隆特征,研究人员利用测序来评估668个血液样本中存在的突变,这些样本来自439名再生障碍性贫血患者。研究人员对所有样本开展靶向基因测序,重点关注106个之前与髓系肿瘤相关的基因,其平均覆盖度达到1248倍。
利用测序的数据,他们发现156名患者存在体细胞突变,其中56名患者携带两个或更多的基因突变。超过四分之三的突变落入少数基因中,如BCOR、BCPRL1、PIGA、DNMT3A、和ASXL1。此外,超过10%病例的6号染色体出现小问题,与阵发性睡眠性血红蛋白尿症存在关联。
之后,研究人员对52名患者的135个样本进行了外显子组测序,平均覆盖度达到112倍。他们在25个病例中发现了体细胞突变事件。
结果表明,再生障碍性贫血的发展往往伴随着一些克隆的减少或维持,以及另一些克隆的扩增。前者包括含有BCOR、BCORL1或PIGA突变的克隆,而后者的特点是含有DNMT3A和/或ASXL1突变。
DNMT3A、ASXL1和RUNX1中突变的存在与无进展生存期和总生存时间较短相关。相比之下,BCOR和BCORL1的突变则对应了免疫抑制疗法的良好预后。
不过,研究人员也指出,克隆动态似乎变化很大,这让预后难以判断。此外,随着年龄增长,血细胞逐渐积累突变,这似乎让预测进一步复杂化。“通过深度测序和SNP芯片核型分析密切监控克隆,并结合临床评估,才能判断预后并指导治疗,"他们总结道。
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