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异黄酮是典型的植物雌激素，大豆异黄酮既能代替雌激素与ER结合发挥雌激素样作用，又能干扰雌激素与ER结合，表现为抗雌激素样作用。大豆异黄酮显示雌激素活性或抗雌激素活性主要取决于受试对象本身的激素代谢状态。对高雌激素水平者，如年轻动物和雌激素化的动物及年轻妇女，显示抗雌激素活性；对雌激素水平较低者，如幼小动物、去卵巢动物、绝经妇女，显示雌激素活性。大豆异黄酮的雌激素样作用对老年妇女许多和激素撤退相关的疾病如血脂升高、动脉粥样硬化和骨质疏松等，有一定的预防和治疗作用。
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