液相色谱仪和大多数分析仪器一样，对仪器周围的环境有一定的要求，但没有太特殊的的要求，满足一般分析仪器室的基本条件，就能保证仪器的稳定运行和安全操作。
（1）照明：
室内照明要光线适中，避免阳光直射。为避开直射光线对仪器操作、观测的影响，仪器(显示屏)应侧向光线。实验室窗户要挂窗帘，以便随时调节光照强度。
（2）通风：
使用液相色谱仪分析过程中，由于流动相中含有挥发性有机溶剂（甲醇、乙睛等）会产生有害气体，对仪器中的光学元件带来腐蚀，应注意仪器室的通风，以排除室内有害气体、保持空气清新。
通风主要有两种方式:一种自然通风，定时打开门窗，让内外空气对流;另一种是强制通风，如用通风柜、排风扇等，及时将有害气体排出室外。
（3）环境温度和湿度：
适宜的温度和湿度是保障HPLC仪正常运行、性能稳定的必要条件。
HPLC 仪一般要求室温在20一30℃之间，日温度变化2一3℃，不要波动太大，否则，在开机分析时会影响色谱分离;
夏季一定要控制室温不要超过30℃，温度太高会使流路系统产生气泡，影响检测器的正常工作（如荧光检测器）。室内相对湿度应控制在60%以下。
（4）供电：
液相色谱室应设有照明电源和动力电源，动力电可供仪器运行使用。为减少噪音的干扰，仪器应远离瞬时供电的大功率电器设备，如:大型电动设备（超低温冰箱、电烤箱等）、电梯、空调系统等。为保证HPLC*的精度，必须要保证稳定的输人电压，为此，建议色谱室应设有和仪器负荷相当的稳压电源。室内墙上应安装有接地电阻符合要求的地线，用于仪器设备保护性接地的公用地线接地电阻≤4Ω[4]。
（5）洁净度：
悬浮于空气中的颗粒物质会对色谱仪器分析带来干扰，使本底和噪声升高，成为分析测试的污染源，直接影响高纯物质的纯度与痕量杂质的分析。
HPLC仪器为台式，检测器及光路系统封闭在仪器内部，受地面和空气中尘埃干扰较小，一般不需要缓冲间隔离，但也要注意保持室内清洁，特别是当仪器放在一层时，由于空气中的灰尘较大，为截住颗粒物污染源，要经常清扫地面、桌面，使仪器不积尘、不吸附尘土。
特别是在开机之前，要把仪器周围环境打扫干净，防止仪器通电后会吸附周围的灰尘，对分析带来干扰。
