当前位置:信帆生物>>技术文章>>信帆生物:miRNA与癌症:了解它们之间的关联
在肿瘤发生的经典模型中,癌症通过慢慢积累突变、放任细胞增长而发生。许多这样的突变影响关键的调控蛋白,如原癌基因和抑癌基因。不过,非编码RNA基因的突变也同样有害,尤其是microRNA。
microRNA(miRNA)是一类22个核苷酸的调控转录本。它们与mRNA靶点相结合,或抑制其翻译,或诱导其降解。因此,它们也像转录因子一样,影响基因表达。
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根据Brigham妇女医院的Sean Lawler在2014年发表的综述,*个将miRNA与癌症相关联的线索发表于2002年,研究发现慢性淋巴细胞白血病中的miR-15和miR-16缺失,导致它们的靶点BCL2上调。自那时起,人们开始研究miRNA在癌症中的作用。
如今,研究人员已经鉴定出数千个miRNA,并积极研究它们的生物学,以及它们是否能作为疾病、预后或治疗反应的生物标志物。各种各样的工具也应运而生,协助研究人员更好地了解miRNA的作用。
模拟物和抑制剂
大多数的miRNA工具分成两大类:miRNA操控和miRNA表达分析。
操控这一类主要是miRNA模拟物、抑制剂和表达构建体。模拟物和抑制剂是合成分子,顾名思义,模拟miRNA的表达或阻断它们的调控能力。表达构建体让研究人员能通过一个或多个miRNA基因的转录,在靶细胞上施加影响。
Dharmacon(现属于GE Healthcare)提供模拟物和抑制剂;这些可通过转染导入细胞。据Dharmacon研发主管Melissa Kelley介绍,研究人员可以在相同条件下、不同的孔中使用模拟物和抑制剂,寻找相反的表型,以便对结果更加自信。
Dharmacon也提供慢病毒表达的模拟物,称为shMIMIC lentiviral microRNA,用于那些无法轻易转染或需要活性的细胞。据Kelley介绍,shMIMIC lentiviral microRNA是短的发夹结构,在细胞中表达并被处理成成熟的miRNA,以验证表达特定的miRNA是否能让细胞恢复正常生长。
表达工具
与所有RNA一样,研究人员也可以利用新一代测序(NGS)、芯片、qPCR和原位杂交等方法来定量miRNA。
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