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技术文章

使用合成核苷酸作探针实验

阅读:283发布时间:2015-6-23

实验材料    核苷酸
试剂、试剂盒    SSC焦磷酸钠SDS
仪器、耗材    培养箱水浴锅
实验步骤    
1.  制备双份的转印细菌菌落或噬斑的硝酸纤维素滤膜(处理和干烤过)。

2.  在室温下用3× SDS / 0.1%SDS溶液500 ml 洗膜3~5次。

3.  然后在65℃洗膜至少1.5 h 以上直至过。
 
4.  在预杂交液中37℃预杂交1 h。
 
5.  在装有20 ml 以上的SSC杂交液的可封口的杂交袋中可移入多达20张的滤膜。

6.  在毎 个杂交袋中每毫升杂交液加入0.125 ng 至1.0 ng 的每种32P标记的寡核苷酸。

7.  在以下给定的温度条件下寡核苷酸杂交14~48 h。

(1)14碱基——室温

(2)17碱基——37℃

(3)20碱基——42℃

(4)23碱基——48℃
 
8.  从杂交袋中取出滤胰,用6×SSC / 0.05%焦磷酸盐洗膜液在室温冼膜3~5次,每次 5~15 min。

9.  再用预热的洗膜液洗膜30 min。预热温度与寡核苷酸片段长度有关。

(1)14碱基——37℃

(2)17碱基——48℃

(3)20碱基——55℃

(4)23碱基——60℃
 
10.  如果滤膜高于本底放射性活性,则需要将洗膜温度升高2~3℃,并延长洗膜15~ 30 min。

11.  重新作放射自显影检测。但不得超过以下对应的温度:

(1)14碱基——41℃

(2)17碱基——53℃

(3)20碱基——63℃

(4)23碱基——70℃
 
12.  用塑料薄膜包裹滤膜,放好,使用增感屏在-70℃对X光片曝光14~72 h,双份滤膜均对X光片曝光,如果在同一位置出现曝光点,那么该位置对应的细菌菌落或噬斑为阳性。
实验材料    寡核苷酸
试剂、试剂盒    LBSDSEDTATMAC
仪器、耗材    水浴锅离心机培养箱尼龙膜
实验步骤    
1.  按“在氯化钠/柠檬酸钠中杂交"介绍的方法处理已影印细菌菌落的滤膜。

2.  按下列方法制备带扩增噬斑的滤膜

(1)从文库中以渐减密度〔15 000~8 000噬斑 / 150 mm 平板)的方式将噬菌体铺在琼脂糖平板上。

(2)37 ℃培养至长出可见的噬斑。

(3)将噬斑影印到硝酸纤维素滤膜或尼龙膜后,滤膜移至预热的LB琼脂糖平板上,37℃培 养5~12 h(转印后冷室保存主平板)。

(4)将影印到膜上的噬菌体DNA变性并使之结合到滤膜上。
 
3.  转印细菌菌落的滤膜按“在氯化钠/柠檬酸钠中杂交"的步骤1洗膜,然后将滤膜浸入50℃ 2×SSC / 0.5%SDS / 50 mmol/l EDTA,pH8.0溶液中洗涤,尽可能冼去滤膜上影印的细菌残渣,然后用同洋的溶液再洗1遍。
 
4.  按每张滤膜5~10 ml 预温的TMAC杂交液量,在15 cm 玻璃水晶盘中可移入多达30 张的滤膜,用塑料保鲜膜将玻璃盘封好。

5.  在杂交温度下预杂交1 ~2 h。杂交温度和洗膜温度均应比解链温度低5~10℃。
 
6.  预杂交后,将滤膜转移到一个装满新鲜、预热的TMAC杂交液的杂交容器中。

7.  并按毎毫升杂交液加入1×106~2×106 cpm35P标记的寡核苷酸探针,于适当的温度下温育40~60 h。
 
8.  室温下每张滤膜先用5~10 ml TMAC洗液洗涤,然后分别将滤膜转移到200~ 250 ml 新鲜的TMAC洗液中,轻轻振荡洗涤15 min。
 
9.  换上等体枳预热的TMAC冼膜液,在适当的洗膜温度下温育1 h。

10.  再用等体积的2×SSC / 0.1%SDS洗膜液在室温下洗膜,共3次,每次约10 min,以去除TMAC。

11.  zui后按“ 在氯化钠/柠檬酸钠中杂交"进行放射自显影。



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