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*酰化探针的制备实验

阅读:284发布时间:2015-05-14

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*酰化探针的制备实验
实验材料    DNA
试剂、试剂盒    DNA聚合酶dNTP2-疏基乙醇*甘油NaClEDTASDS无水乙醇
仪器、耗材    注射器电泳仪离心机培养箱
实验步骤    
1.  混合以下物质于100 μl 反应体积:

(1)10 μl  10×大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ缓冲液

(2)10 μl  0.5 mmol/l 3dNTP混合液

(3)10 μl  0.5 mmol/l *-11-dNTP贮存液

(4)10 μl  0.5 mmol/l 2-ME

(5)2 μg  DNA

(6)20 U  大肠杆菌聚合酶Ⅰ

(7)DNA酶Ⅰ贮存液,用钱用冷水稀释1000倍

(8)加水到100 μl,15℃温育2~2.5 h。

2.  取6 μl 反应液,煮沸3 min 置于冰浴2 min。
 
3.  加样于琼脂糖凝胶,同时带对照分子量标准,在15 V/cm 电压降下电泳。
 
4.  消化的DNA大小介于100~500 bp 之间,接步骤5继续,若大小在500~1 000核苷酸之间(或更大)加入第二份DNA酶Ⅰ继续温育。
 
5.  加入2 μl,0.5 mol/l pH8.0的EDTA和1 μl 10%SDS,68℃加热10 min 终止反应和灭活DNA酶Ⅰ。
 
6.  在1 ml 注射器中准备如Sephadex G-50离心柱,用2 ml 无水乙醇清洗注射器和硅化的玻璃棉。

7.  接着用4ml H2O冲洗,将G-50介质装入注射器至刻度,用100 μl SDS柱缓冲液冼3~4次,上样。

8.  分离*酰化的探针。探针浓度应约为20 ng/μl ,探针可直接使用,也可在-20℃保存数年而不丧失活性。
 
9.  用比色法估计*酰化反应的程度和探针的质量或进行化学发光检测。

随即寡核苷酸引物合成法

实验材料    DNA
试剂、试剂盒    dNTP*klenow酶TEEDTALiCl乙醇
仪器、耗材    离心机培养箱
实验步骤    
1.  在1. 5 ml 离心管中加入500 ng~2 μg 模板DNA,加水至总体积为34 μl。
 
2.  在沸水中变性DNA 5 min 置于冰浴5 min,稍加旋离。

3.  按顺序加入下列溶液:

(1)10 μl  *酰化随即多聚体

(2)5 μl  dNTP/*混合物

(3)1 μl  klenow酶(5U)

(4)37℃温育1 h。
 
4.  加入3 μl 0.5 mol/l EDTA pH8.0以终止反应。加入5 μl 4 mol/l LiCl和150 μl 冰冷的无水乙醇,置于冰浴30 min。

5.  室温高速离心10 min,沉淀用70%乙醇洗涤。
 
6.  DNA用20 μl pH7.5的TE缓冲液重悬。用比色法或化学发光法估价*酰化反应的效果。


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