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实验步骤
1. 蛋白质双向电泳
1) *向固相pH梯度等电聚焦电泳
a. 上样:*向等电聚焦采用胶内加样的方法进行。吸取一定量的蛋白样品(银染样品的蛋白上样量为140 ug计,考染样品为1.3 mg)加入重泡涨液(8 mol/L尿素,2%CHAPS,痕量滨酚蓝,20 mmol/L DTT,0.5 % IPG buffer),使终体积达到350ul。混匀后均匀加在IPG胶条holder的正、负极之间。将预制IPG胶条(pH 3 -10 NL)除去保护膜,胶面向下,覆于holder中的样品之上;慢慢下压胶条,并前后移动,避免生成气泡。在胶条上方均匀封以1 ml覆盖油,盖上盖子。
b. 等电聚焦:将装有样品和IPG胶条的strip holder置一向电泳仪(IPGphorTM Isoelectric Focusing System)上进行等电聚焦。等电聚焦参数:0V电压下泡涨3h,30V电压下泡涨10 h,500 V电压下电泳0.5 h,2000V电压下电泳0.5 h,5000 V电压下电泳0.5 h,8000 V电压下电压20 h。
c. 胶条的平衡:*向电泳结束后,取出IPG胶条平衡两次,每次15 min。平衡缓冲液(50 mol/L Tris buffer pH 8.8,6 mol/L尿素,30甘油,0.8 g澳酚蓝,20 mmol/L DTT,含2 % (w/v) SDS)可减少电内渗,有利于蛋白质从*向转移到第二向。在第二步平衡中用100mmol/L碘乙酞胺代替DTT以除去*步平衡时的DTT。平衡后的IPG胶条沿边缘用滤纸吸去多余的平衡液。
2) 第二向垂直SDS-PAGE
根据IPG conversion Kit的体积,配制大小为200 mmX200 mmX 1mm,浓度为12.5%T,3.3%C的均匀胶。将平衡好的IPG胶条移至凝胶上方,用0.5%琼脂糖电泳缓冲液封闭。电泳的缓冲液系统为Tris-Glycine-SDS系统(500 ml,SX,7.5 g Tris,2.5 g SDS,36 g Glycine)。一向胶条和二向胶接触面避免气泡产生;封胶温度不能过高,封胶时不要引入气泡。
电泳参数设置:14-15℃恒温下,以每胶条计
20 mA恒流电泳40 min
30 mA恒流电泳至澳酚蓝电泳到底部。
2. 染色
1) 银染法:将二向电泳完成后的SDS-PAGE转移至固定液(40%无水乙醇,10%冰醋酸)中,固定30 min;弃固定液换敏化液(30%无水乙醇,6.8%醋酸钠,0.2%*,0.5%戊二醛)敏化30 min;弃敏化液,以双蒸水200 ml洗2次,每次30 min;之后置于银染液((0.25%*,40%甲醛)染色20 min,染色时避光;弃银染液,以双蒸水200ml洗2次,每次1 min;显色液((2.5%碳酸钠,20%甲醛)显色2-5 min,至蛋白质点*显现为止;弃显色剂,立即换终止液(1.46 %EDTA),终止显色10 min;以超纯水洗3次,每次5 min。
2) 考马斯亮蓝染色(考染)法:将二向电泳完成后的SDS-PAGE转移至固定液(50%无水乙醇,10%冰醋酸的水溶液)中,固定30 min以上;弃固定液,加入染色液(10%冰醋酸,G-350过滤所得),热染10 min;之后转移至脱色液中(10%冰醋酸水溶液)过夜,直至背景色脱尽;超纯水清洗。
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