水样采样器根据应用的场合，可以分为固定式在线式采样器与便携式可移动采样器以及手持式采样器。根据是否可将水样进行恒温冷藏，又可分为恒温冷藏式水质采样器和普通不可冷藏式水质采样器。
同时根据样品瓶数量，可分为单样品瓶采样器和多样品瓶采样器。根据功能性，又可分为多功能自动水质采样器和手动采样器。
固定式在线式采样器一般会与在线水质监测设备联机运行，比如与在线式COD检测仪、在线式氨氮检测仪等实现超标留样功能。
与数据采集传输仪联动实现远程控制采样功能;便携式水质采样器一般应用于户外或者野外的水质自动采样。它要求采样器体积要便于移动，稍大一些的便携式采样器一般会具有底轮、拉杆等附件，便携式采样器还需要具有备用电源。以应用于无外电源的场合，好的便携式水质自动采样器会具有车载充电或太阳能供电等模式;手持式水质采样器主要进行即时采样。例如河道、沟渠等。环保监测监察人员需即时随地进行水样的采集，便于取到更有效的更具有代表性的当时的水样。
除了固定式和便携式的，还有一些两用的，可以做在线水质采样，也可以便携式水质采样，水质采样器采用一体式设计，整机嵌入坚固的一体式设计工具箱内，整机防水设计，外壳坚固，功能丰富，操作简单，可全天应用。无需有复杂的专业知识，该产品非常方便用户便携应用，亦可在某些特定的场合作为在线采样器使用，性价比高，满足用户的比较大应用需求。
恒温冷藏式水质采样器可以实现对水样的恒温存储，因为现场采集的水样往往比较多，间隔时间比较随意，检测人员不能实现实时的取样进行检测。因此需要将水样置于要求的恒温环境下以便于能够保证水样不变质，保证水样测量指标的准确性代表性。
