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上海源叶生物科技有限公司
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阅读:568发布时间:2015-11-4
细菌几乎无处不在,可你有没有想过,空间站中主要有哪些细菌?近日,美国国家 空*(NASA)下属的喷气推进实验室(JPL)开展了一项研究,发现空间站中的细菌大多与皮肤相关,如放线菌。他们在《Microbiome》上发表了这一成果。
喷气推进实验室的Kasthuri Venkateswaran及其同事收集了空间站(ISS)以及JPL两个净室的灰尘样本,这两个净室主要用于航天器部件的组装。通过细菌培养和定量PCR分析,研究小组估计了微生物群体,并利用测序鉴定出两个环境下的微生物组。
定量PCR分析表明,空间站的样本有着zui高的细菌密度。不过在经过PMA处理后,这种差异就不再明显。ISS HEPA样本中的活细菌比例是1.7%,ISS真空样本中的活细菌为2.7%,净室JPL-103中的活细菌为4.5%。然而,另一个净室JPL-SAF中活细菌的比例高达66.8%。
通过细菌培养,研究人员鉴定出41个细菌菌株,其中大多数属于厚壁菌,少数属于变形菌。他们指出,杆菌在两个ISS样本中占优势,不过葡萄球菌只存在于真空样本中。他们补充道,净室样本中缺乏或很少有这两个属。
通过罗氏-454的焦磷酸测序,Venkateswaran及其同事产生了大约10万条细菌序列,读长超过500 bp。在利用PMA去除死细胞后,ISS真空样本有着zui高的序列数量,超过3万条,而HEPA过滤器样本的数量zui低。研究人员指出,HEPA过滤器的几乎所有序列都属于棒状杆菌,这也存在于真空样本中。
Illumina MiSeq系统上的测序又产生了680万条序列。通过这些序列,研究人员发现,ISS样本以放线菌、杆菌和梭菌为主,而净室样本则含有高水平的α-变形菌和γ-变形菌。研究人员认为,空间站和净室样本之间的差异是明显的。
利用焦磷酸测序,Venkateswaran及其同事还发现了35,000条真菌序列,其中大部分属于座囊菌纲、散囊菌纲和银耳纲。他们指出,真菌的丰富度与位置有很大关系,在净室中大多为座囊菌和散囊菌,而ISS样本中含有更多散囊菌和酵母菌等。
总的来说,Venkateswaran及其同事报告称,空间站和净室中的微生物群落存在明显的差异。空间站的样本以放线菌为主,这可能是因为宇航员在那里生活。而净室中的放线菌数量则通过更衣过程来降低。
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