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蛋白质组学牛人Nature发表重要新成果

阅读:232发布时间:2015-12-3

来自斯克里普斯研究所(TSRI)的科学家们找到了证据证实,导致大多数囊性纤维化病例的一种突变蛋白,由于忙于与错误的细胞邻居“说话”,以致其无法正常发挥功能而过早地降解。
通过解除这种喋喋不休的谈话,可部分程度上恢复这一蛋白的正常功能。研究结果表明,有朝一日一些治疗方法有可能可以治疗囊性纤维化的根源,而不只是缓解疾病的症状。这一重要的研究发布在11月30日的《自然》(Nature)杂志上。
领导这一研究的是斯克里普斯研究所生物学与化学生理学系教授、蛋白质组学专家John R. Yates教授。Yates教授二十多年来致力于质谱技术在生物学中的应用研究,开发了SEQUEST软件和多维蛋白质鉴定技术平台(MudPIT),突破性地推动了蛋白质组学的发展,于2011年荣登“2000-2010年*一百位化学家”名单。
论文的共同*作者、Yate实验室助理研究员Casimir Bamberger说:“我们鉴别的蛋白质和相互作用将真正推动发现囊性纤维化新药物治疗靶点的管道。”
囊性纤维化根源
囊性纤维化可引发患者肺部产生过量的粘液,导致持续性的感染。尽管某些治疗方法如用抗生素对抗感染可以处理一些症状,但当前却没有办法*恢复肺脏功能(延伸阅读:Nature子刊:基因编辑校正致病突变 )。
Bamberger、共同*作者、TSRI研究员Sandra Pankow及同事们认为,更好地认识囊性纤维化跨膜传导调节因子 ( CFTR )是开发出新疗法的关键。大多数囊性纤维化患者CFTR编码基因均具有一种叫做ΔF508的突变,它阻碍了CFTR在细胞内正确地折叠及加工。
联川生物为研究人员的蛋白—蛋白互作分析提供蛋白结合芯片服务 
有趣的是,以往的研究表明突变CFTR在低温下可以恢复正常的功能。
Pankow说:“冷冻人们当然无法成为一种现实的疗法,但这向我们表明突变CFTR可以具有功能。因此我们新研究的目的在于,找到可以模拟出我们在低温下看到的效应的新候选药物。”
寻找药物靶点
在新研究中,研究人员利用一种称作为共同纯化蛋白鉴别技术(CoPIT)的工具来分析了细胞样本,CoPIT是他们开发出来鉴别蛋白质及分析数据的一种新方法。有了CoPIT,他们可以鉴别出几乎所有与CFTR互作的蛋白——甚至追踪二级和三级的蛋白质相互作用。
结果是令人惊讶的。人们原以为大多数突变蛋白只是缺失了一种或两种至关重要的互作,而事实是ΔF508 CFTR突变体获得了一种全新的“疾病特异性”互作网络。
Pankow说:“300种蛋白改变了它们的互作水平,有额外200种蛋白与突变CFTR发生了互作。就好像突变CFTR一直在与错误的人对话。”
研究人员将这些突变蛋白质互作范围缩小至8个关键的破坏性蛋白。研究人员随后采用一种基因沉默方法来删除或“敲低”这些蛋白,阻断了这些蛋白与ΔF508 CFTR互作。他们发现没有这些额外的互作,ΔF508 CFTR部分恢复了正常功能。
Pankow和Bamberger说,研究的下一步是寻找一些可以靶向这些破坏性蛋白的候选小分子药物。研究人员还公开地发布了他们的原始CoPIT数据,让其他的科学家们可以探讨这些CFTR互作的临床意义。


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