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Science重要成果:重写全基因组

阅读:172发布时间:2013-10-18

在发表于一期《科学》(Science)杂志上的两项平行研究中,研究人员在大肠杆菌中构建出了新的基因组,由此测试了遗传编程的极限,并为提高生物技术的灵活性、产率和安全性开辟了新的可能性。

在*项研究中,研究者们采用同义的UAA密码子,替换了大肠杆菌整个基因组中的所有321个特异的UAG密码子,这使得释放因子1(RF1)被敲除,并重新定义了UAG的翻译功能。由此使得细菌生成了自然界通常不存在的蛋白质,提高了对病毒的抵抗力。

在第二项研究中,研究人员移除了42个大肠杆菌基因的13种不同的密码子,每个基因采用一种不同的大肠杆菌,并用其他具有相同功能的密码子取代了它们。当研究人员这样做时,42个靶基因的24%的DNA发生了改变,而这些基因生成了与原始基因生成的相同的蛋白质。

哈佛医学院George Church实验室研究生Marc Lajoie说:“*篇论文是说,我们可以*从基因组中移除一种密码子,然后成功地重新它的功能。在第二项研究中,我们提出了这样的问题‘好吧,我们已经改变了这一密码子,我们还能够改变多少其他的密码子?该研究所选择的13种密码子,全部都能够被改变。”

“这为我们揭开了一种可能性:我们有可能能够替换整个基因组所有这13种密码子或是其中任何一个,”Lajoie说。

朝着更安全,更多产,更灵活的生物技术

重新编码的基因组可以为大肠杆菌提供保护对抗病毒,并帮助防止将潜在危险的遗传改造性状传播给野生型生物。

*篇论文的共同资深作者、耶鲁大学医学院分子、细胞和发育生物学助理教授Farren Isaacs说:“这些结果有可能为生物技术生成打开了一个全新的化学工具箱。例如,添加持久聚合物到一种治疗分子中,有可能使得它能够在人类血流中更长时间发挥功能。但要获得这样的影响,需要一次改变大片的基因组。”

Church说:“如果我们做出少许的改变,使得微生物略微更具抗病毒能力,病毒将会抵消这一效应。它变成了一个来回反复的斗争。但如果我们能够让微生物脱机,生成大量的改变,当我们将它带回展示于病毒面前时,病毒将会说‘我投降’。任何的天然病毒群产生再多的多样性,也不足以抵消这一极其全新的基因组。”

在*项研究中,仅移除了一个密码子,就提高了基因组重编码生物体的抗病毒感染力。Church说,相同潜力的“全新基因组”不可能操控基因转而进入到野生种群,因为它们与自然基因组不相容。这对于遗传改造耐药或抗杀虫剂的菌株具有极大的益处。并且,整合的罕见、非标准氨基酸确保了菌株只能在实验室环境中存活。


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