耐**（MRSA）也被称作“超级细菌”，是医院感染的主要致病菌之一。近日，来自英国、澳大利亚和泰国的研究人员利用基因组测序，成功理清了MRSA的复杂传播模式。这项成果于12月9日在线发表于《Genome Research》上。
Wellcome Trust Sanger研究院等机构的研究人员利用基因组测序评估了76个样本，这些样本来自泰国东北部一家医院的无症状患者和员工，他们被确定为MRSA携带者。MRSA序列的系统发育分析表明，同一序列类型的至少五个分支在成人和儿科病房中同时传播，而了解这些分离株为病原体的遗传多样性以及在个体之间的运动提供了线索。
过去，对于那些积极筛查或已采取感染控制措施的医院，研究人员借助全基因组测序来了解MRSA的关系和传播模式。然而，对于那些无法获得足够的财政资源或感染控制资源的医院，即MRSA传播很普遍的环境，人们还不太清楚细菌如何传播。
文章的通讯作者，Sanger研究院的Sharon Peacock指出：“了解MRSA如何在这些环境中传播很重要，它不仅突出了问题，也为干预这种病原体指明了方向。这项研究是为了确定这些医院中MRSA的系统发育和传播动力学。”
在2008年的三个月中，研究人员从重症监护室的169名成人患者、儿科ICU的98名儿童以及两个病房的30多名护士中收集了*和指尖培养物样本。16%的ICU患者和1/3的儿童患者被检测出MRSA阳性。此外，ICU的1名护士和儿科ICU的4名护士呈MRSA阳性。
之后，研究小组对这46名患者和5名员工的76个MRSA分离株进行基因组测序。它们都属于*ST 239序列类型，不能通过基因分型分析准确区分。将产生的序列与ST 239参考基因组比对之后，研究人员鉴定出超过1,500个SNP，随后用于系统发育树的建立。
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通过查看这些变异聚集的方式，研究人员确定了至少五个MRSA分支，包括在医院内传播的67个分离株。三个分支的分离株主要在成人ICU的患者和员工上检测到，而另外两个则通常出现在儿科病房。不过，每个病房中仍有一名员工不能*归到这五个分支，但与2006或2007年鉴定出的分离株类似，暗示她们可能在其他医疗保健机构染上MRSA。
利用基因组序列，研究小组追踪了病房内以及病房之间的传播模式，以及分离株存在的遗传多样性。后者包括是否存在质粒，包含与抗生素和/或抗菌素耐药性相关的基因
“序列数据带来的惊人结果是存在多个不同的分支，这表明一些不同的MRSA变异体同时在医院中传播，”Peacock谈道。“我们还确认了患者进入ICU之后的传播事件，并在每个病房中发现一位‘超级传播者’。
