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公司动态

单个噬菌体插入区域PCR产物的测序

阅读:572发布时间:2010-8-4

[器材和试剂]
● ABl 377型测序仪
● ABI的BigDye染液
● ABl 9700型PCR仪器
● ABI蓝色葡聚糖/EDTA上样缓冲液
● 3mol/L的乙酸钠
● 95%及70%的乙醇
● 0.4pmol/ul的fUSE5“超级反向”引物,或T7“超级上游”引物
● 一台带Qiagen 2X 96平板转子或同等转子的Qiagen 4K15C型离心机

[方法]
1.将测序反应成分混合于10ul的反应体积中:1.5ul来自PCR扩增的PCR产物, 2.5ul的MilliQ纯水,2.0ul浓度为0.4pmol/ul的{USE5“超级反向”引物或T7“超级上游”引物(共0.8pmol),4.0ul的Big Dye染液。
2.在以下条件下完成热循环:94℃放置2分钟;分别在3个温度下进行PCR,进行30次循环,分别是96℃下45秒、50℃下20秒以及60℃下3分钟;放置在4℃下直到准备纯化为止。
3.向10ul的测序反应体系中加入1ul 3mol/L乙酸钠和25ul 95%乙醇。
4.在-20℃下孵育60分钟以沉淀产物。
5.在带Qiagen 2X 96平板转子或同等转子的Qiagen 4K15C型离心机中,6000r/min(5788g) 离心20分钟。
6.迅速翻转96孔板,并将乙醇轻轻甩出。
7.用125ul的70%乙醇洗涤。
8.在带Qiagen 2X96平板转子或同等转子的Qiagen 4K15C型离心机中,6000r/mln离心5分钟。
9.迅速翻转96孔板,并将乙醇轻轻甩出。
10.在一个96孔加热板上干燥15分钟。
11.将样品悬浮于1.5ul的ABI蓝色葡聚糖/EDTA上样缓冲液中。
12.每份样品取0.8ul上样到一块预制的聚丙烯酰胺测序胶上,并在ABl 377测序仪上跑3.5小时。
13.用序列分析软件来分析数据,如SequencherTM(GeneCodesCorp)。

 


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