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上海源叶生物科技有限公司
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阅读:770发布时间:2010-8-6
制备好DNA文库后,用标准方法将DNA电转人大肠杆菌中,得到转化株并保存,然后制备噬菌体用于分析和筛选。在液体培养基中将转化后的细胞进一步培养到对数生长期。经过在液体培养基中的增殖,一些菌液用于甘油保种,剩下的用于制备噬菌体。或者可以通过将整个转化体系铺在含有选择性抗生素的琼脂平板上,而直接从固体培养基上得到转化株。相信这个方法可以在保险性储存的过程中,阻止一些特殊克隆的优势生长。
电转化和噬菌粒文库的储存,甘油保种的制备以及筛选所需的噬菌体的制备
[器材和试剂]
● 2TY/Carb/Tet琼脂平板 (31g/L2TY,15g/L琼脂,100/lg/m1羧苄*和10ug/ml四环素):取31g 2TY、15g琼脂,加水至1L,然后高压灭菌。待溶液冷却至40℃,然后加入lml羧苄*(100mg/m1)和1ml四环素(10mg/m1),充分混匀后铺于皮氏培养皿中。
● 大肠杆菌电感受态细胞;如XLl—Blue的电感受态细胞(Stratagene)
● 将DNA电转进大肠杆菌的试剂和设备
● 2TY和2TY/G1u培养基(含有或不含2%葡萄糖的31 g/L的2TY培养基):将31g 2TY加入1 L水中,搅拌溶液让2TY溶解后灭菌,待溶液冷却,取100m1分装入一个无菌的锥形瓶中,并加入10m1 20%(w/v)的葡萄糖(过滤灭菌)。
● 10mg/m1的四环素:溶于超纯水后过滤灭菌
● 100mg/m1的羧苄*:溶于超纯水后过滤灭菌
● 100mg/m1的*:溶于超纯水后过滤灭菌
● 无菌的-50%的甘油水溶液
● *抗性的VCS—M13辅助噬菌体储液(1010pfu/m1)(Stratagene)
● PEG-NaCl溶液:20%PEG,2.5mol/l NaCl
● 磷酸盐缓冲液(PBS) (2 mm01/L NaH2P04,16mmol/L Na2HP04,150mm01/L NaCl,pH 7.4~7.6):将8g NaCl、0.2g KCl、1.44g Na2HPO4和0.24g NaH2PO4溶于800m1去离子水中,用盐酸调节pH至7.4,然后加水至1L。
● DNA文库
● Oakridge 型 40m1 离,乙,管 (Nalge Nuno)
● Sorvall RC 5Cplus型离心机及SS—34型转子,或其替代物
[方法]
1,取10/Il得自实验方案8.2中步骤6的混合物, 电转入大肠杆菌的dut+ung+型菌株 (如XLl—B1ue) 中。大文库容量的文库可能需要多次电转化。在我们对泛素系统的研究工作中,我们将文库电转入购自Strat agene的XLl—Blue电感受态细胞。可以替换的菌株包括SS320或TGl。
2.将电转后细胞的适当稀释液铺于2TY/Carb/Tet0琼脂平板中, 以测定转化株的数量。随后可以使用平板上的菌落,通过PCR、限制性酶酶切及测序,来检验文库。
3.在250ml的锥形瓶内,将电转后的菌液(得自步骤1)加入到40m1含有12ul 100mg/ml的羧苄*和20/A1 10mg/ml的四环素的2TY/Glu培养基中。
4.将菌液在37℃振荡培养至对数生长期,直到OD600=0.5,这通常需要4—5个小时。l小时后将12ul 100mg/ml的羧苄*20ul 10mg/ml的四环素①加入到锥形瓶中。
5.取出4m1菌液,加入1.5ml 50%的甘油,每管1m1分装后于-80℃储存。
6.将4ml VCSMl3辅助噬菌体(约1010pfu/ml)加入到剩余的菌液中,以使噬菌体与大肠杆菌之比达到10倍左右。将锥形瓶子37℃静置15~30分钟。
7.将l/4的菌液(约10ml),分别加入到4个含有100ml 2TY/Glu培养基、75ul 1100mg/ml的羧苄*和100ul 10mg/ml的四环素的250m1锥形瓶中。将锥形瓶于37℃振荡培养,直到菌液开始轻微变浑(约2小时)。
8.加入70ul 100mg/ml的*,并于37℃振荡培养过夜。
9.第二天上午,将每份过夜培养的菌液各自分装入3只Oakridge离心管中,在Sorvall RC 5C plis型离心机中使用SS—34转子, 于4℃12000 r/min离心15分钟。
10.从每只离心管中取出30ml上清液,并与7.5ml PEG—NaCl溶液混合,以沉淀噬菌体颗粒。将这些离心管于冰上放置1小时,偶尔混匀液体。
11.如步骤9中所述,于12000r/min离心15分钟,吸出并弃去上清液。
12.将噬菌体沉淀重悬于PBS中,每管1ml。将重悬后的噬菌体转移至新的小离心管中,开用小型离心机于10000r/min离心,除去不溶性的残渣。将干净的上清液转移至新的小离心管中并于4℃保存。
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