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BMC Genomics:鉴定蟹卵巢小RNA组

点击次数:846 发布时间:2014-7-26

microRNA(miRNA)是非编码小RNA分子,与靶信使RNA(mRNA)的3'-非翻译区(UTR)碱基配对,下调基因表达。然而,关于十足目甲壳动物miRNA的详细信息并不多见。上海海洋大学邱高峰教授带领的团队早期研究发现,中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)的细胞周期蛋白B(cyclin B)的3'-UTR上存在许多miRNA结合位点,暗示miRNA可能在转录后水平调控细胞周期蛋白B。在本研究中,邱教授团队采用测序技术对中华绒螯蟹的卵巢小RNA组进行了全面鉴定,深入探讨了miRNA在卵母细胞减数分裂过程中的作用*,研究成果发表在7月刊的BMC Genomics上。

研究人员采用高通量测序对中华绒螯蟹的卵巢小RNA组进行分析(小RNA测序项目由联川生物承担完成),鉴定出来自44个miRNA家族的55个已知miRNAs,并预测出136个可能存在未知的miRNAs。实验发现,四个miRNAs(miR-2,miR-7,miR-79和miR-133)的5'种子序列,互补于细胞周期蛋白B的3'-UTR的miRNA结合位点。实时定量PCR分析发现,miR-2和miR-133表达丰度在减数*次分裂中期(MI)的表达丰度远高于胚泡期(GV)。但它们的表达增强不依赖于*释放激素(GnRH)的诱导。研究人员采用双荧光素酶报告基因测定法进行进一步表达分析,结果显示miR-2和miR-133可下调螃蟹细胞周期蛋白B基因的3'-UTRs的表达,这表明它们能抑制细胞周期蛋白B的翻译。免疫印迹试验分析证实,在受精卵中,细胞周期蛋白B蛋白会在减数*次分裂的中期—后期过渡中*消失,这表明了在接近MI结束时miR-2和miR-133可能具有破坏细胞周期蛋白B的功能。
此研究中从蟹卵巢小RNA组中鉴定出了大量的miRNAs,同时发现miR-2和miR-133在卵母细胞减数分裂成熟过程中表现出差异表达,并可以调控蟹细胞周期蛋白B基因的3'-UTR。值得注意的是,该研究发现与zui近报道的miRNA活性在小鼠卵母细胞中被整体抑制是不一致的。
* Song YN, Shi LL, Liu ZQ, Qiu GF. Global analysis of the ovarian microRNA transcriptome: implication for miR-2 and miR-133 regulation of oocyte meiosis in the Chinese mitten crab, Eriocheir sinensis (Crustacea:Decapoda) (2014) BMC Genomics doi: 10.1186/1471-2164-15-547 
联川生物为研究人员提供从miRNA发现到靶基因鉴定的全程解决方案

联川生物总部位于美国休斯敦(LC Sciences, LLC),经过多年的快速发展,已成为业界的多组学技术服务商。公司拥有具有自主知识产权的µParaflo®微流体定制化芯片平台,可以为科研用户提供从基因组,转录组,到蛋白组的高通量定制化表达谱芯片解决方案。我们是提供microRNA表达谱芯片分析的服务商。作为早提供高通量测序技术服务的公司之一,联川生物拥有经验丰富的技术团队和*的生物信息学专家组,可以为研究人员提供多组学测序服务和深度个性化数据分析解决方案。为满足研究人员跨组学高通量研究需求,联川生物已将蛋白质组定量分析引入技术服务线,为用户提供贯穿中心法则的全程解决方案。多年来,联川生物一直与国内的科研团队保持着长期紧密的合作,助力科研人员在生物、医学、和农林领域的科学发现。科研用户使用联川生物的科研服务和高质量组学实验数据已发表了逾600篇高水平研究论文,其中已在Cell,Nature,Science系列*期刊上发表论文十七篇。

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