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“蛋白”基因功能

时间:2016/6/23阅读:582
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蛋白基因(蛋白)常见的功能分析方法有:代谢信号通路(pathway)和GO(Gene ontology,基因本体论)分析。另外还有COG(Clusters of Orthologous Groups of proteins)、蛋白功能域(protein Domain)等分析。

功能分析的应用非常普遍,以通路分析为例,其相关的文献逐年增加,2015年相关的文献有42926篇(图1所示)。 所以说基因功能分析是一个非常普遍而且重要的分析内容。

蛋白GO和pathway都是研究基因功能的,那么它们的区别是什么呢?在这里跟小伙伴们科普一下:GO主要是研究基因功能的,而pathway是研究基因和蛋白功能的,是不是一目了然了?GO功能主要分成三大类:BP(生物学过程)、MF(分子功能)和CC(细胞组成);其中zui常用的就是GO BP分析。常见的pathway数据由KEGG、Reactome、Biocarta等。

 

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