SUPER Green I-核酸电泳用试剂

SUPER Green I核酸染料特点

● 无毒性：属花箐类染料，容易生物降解，无致癌毒性。

            ● 灵敏度高：至少可检出20pg DNA，高于EB染色法25～100倍。

            ● 信噪比高：样品荧光信号强，背景信号低。

            ● 操作简单：无须脱色或冲洗，即可直接用紫外凝胶透射仪或可见光透射仪观察。

            ● 适用范围广：可适用于多种凝胶电泳方法：琼脂糖凝胶、聚丙烯酰胺凝胶电泳、脉冲电场凝胶 

               电泳和毛细管电泳等。

            ● 使用方便：对分子生物学中常用的酶（如：Taq 酶、反转录酶、内切酶、T4连接酶等）没有抑 

               制作用。

            ● 经济：价格比银染便宜。

SUPER Green I使用方法简介

1．胶染法（用法同EB）（推荐方法，见图1）

（1） 制胶时加入SUPER Green I 核酸染料。冷却胶至50℃左右，每100mL胶中加入3～5μL

SUPER Green I 核酸染料。

（2） 按照常规方法进行电泳即可。

u       注：此方法染色可以准确确定核酸片段分子量，染料用量相对较少。1mL染料大约可以做300块 100mL的胶。

2．点染法 （见图3）

（1） 该方法适于琼脂糖凝胶电泳和PAGE凝胶电泳。

（2） 工作液的配制：用电泳缓冲液将10000×的SUPER Green I 稀释100倍，即为SUPER Green I 工作液。SUPER Green I 工作液可以置2～8℃保存一个月以上。

（3） 制胶：按常规方法制胶，不含任何染料。

（4） 样品染色：向分析样品中加入SUPER Green I 工作液和载样缓冲液，室温放置10分钟，使SUPER Green I 与样品中DNA充分结合。SUPER Green I 工作液加入量为总上样量的1/5～1/10。

（5） DNA Marker染色：将5μL DNA Marker、5μL DNA Marker稀释液和1μLSUPER Green I 工作液混匀，室温放置5分钟，使SUPER Green I 与DNA充分结合。

（6） 上样、电泳：按常规操作。

u       注：用点染法染色时，灵敏度zui高，染料用量zui少。但大片段稍有滞后现象，如果需要更准确确定分子量（与Marker对比），建议使用胶染法。

3．泡染法

（1） 按照常规方法进行电泳。

（2） 用pH 7.0～8.5 的缓冲液（如：TAE，TBE 或 TE），按照10000﹕1的比例稀释SUPER Green I 浓缩液，混匀，制成染色溶液。

（3） 将染色溶液倒入合适的聚丙烯容器中，放入凝胶，用铝箔等盖住容器使染料避光。室温振荡染色10～30分钟，染色时间因凝胶浓度和厚度而定。聚丙烯酰胺凝胶直接在玻璃平皿上染色，将配好的稀释溶液轻轻地倒在胶板上，让稀释液均匀地覆盖整个胶板，并染色30分钟。玻璃平皿必须预先经过硅烷化溶液处理（避免染料吸附在玻璃表面上）。

u       注：用泡染法染色时，可以确定核酸片段分子量。但染料用量是三种方法中zui多的。

4.  点染＋胶染法（见图2）

此法结合方法1和方法2，灵敏度zui高，对于低浓度样本比EB检测更灵敏。

几种染色方法特点比较

SUPER Green I使用注意事项

（1） 在SUPER Green I点染法中，电泳时间不要超过2小时，否则SUPER Green I会从DNA上分离出来，会产生弥散状条带。

（2） 用点染方法染色时，条带稍有滞后现象，如果需要确定片段分子量（与Marker对比），建议使用胶染法（方法1）。

（3） 在常规用酒精沉淀核酸的过程中，SUPER Green I可以全部从双链核酸上去掉。

（4） 如果想对用 SUPER Green I 染过的胶进行 Southern blots，建议在预杂化和杂化溶液中加入 0.1%～0.3% 的SDS。

（5） 在紫外照射透视下，与双链 DNA 接合的 SUPER Green I呈现绿色荧光。如果胶中含有单链 DNA 则颜色为橘黄而不是绿色。

（6） SUPER Green I对玻璃和非聚丙烯材料具有一定亲合力。建议在稀释、贮存、染色等使用过程中用聚丙烯类容器。