当前位置:上海沪宇生物科技有限公司>>公司动态>>zui热门的基因组测序新成果
种属:家猫(Felis catus)
基因组:3.1 billion bp
家猫会患上白血病也会受到免疫缺陷病毒的感染。为了更好的理解相关疾病,一个跨国科研团队测序了三只家猫的基因组并且进行了注释。这项研究为人们提供了一个新的猫科基因组浏览器——Genome Annotation Resource Fields(GARfield),其中包括血细胞的甲基化模式,以及两万一千多个基因组注释。
虽然此前人们发布过家猫的基因组,不过之前的*枪测序法覆盖度太低,这项研究有助于*之前留下的缺口。此外,这项研究也有一些新发现,比如发现了新的逆转录病毒类似元件和单核苷酸突变。研究显示,家猫基因组中约有55.7%是由重复序列组成的。
种属:南极蠓(Belgica antarctica)
基因组:99 million bp
南极蠓是南极洲*一种*陆生的本土动物,南极蠓测序揭向人们展示了环境对基因组结构的限制。
不能飞的南极蠓是目前基因组zui小的昆虫,但它却具有差不多13,500个功能基因。南极蠓基因组之所以那么小,是因为它的内含子很短,而且重复序列和转座元件。
研究人员指出,在南极蠓中热激蛋白、抗氧化酶、水通道蛋白的表达模式很*。正是这些适应性改变帮助南极蠓在严酷的环境条件下生存下来,在那里干燥、严寒和高紫外线辐射是家常便饭。
“这是测序环境下的昆虫,为以后的比较研究奠定了基础,”华盛顿州立大学的Joanna Kelley说。“此前有研究认为,有效群体大小越小基因组就越大,但我们看到南极蠓正好与此相反。”
种属:新月弯孢霉(Curvularia lunata)
基因组:35.5 million base pairs
新月弯孢霉(Curvularia lunata)在我国造成了玉米作物的严重损失,日前上海交通大学的研究团对这种真菌进行了基因组测序。
研究人员通过比较发现,大约在两千四百万年和五千万年前,C. lunata菌株CX-3和m118从另一种玉米病原体——Bipolaris maydis中分支出来,这三种致病菌现在仍然亲缘紧密。
研究显示,C. lunata菌株CX-3的基因组编码了超过11,000个蛋白编码基因,并且含有一些*的基因组岛,这些区域可能对其毒性非常关键。CX-3中的转座子元件比B. maydis或m118都要多。
研究人员比较了这三种致病菌的转录组,发现与次级代谢通路有关的基因存在表达差异。此外,CX-3的一些基因有助于真菌在压力环境下的生存。这项研究可以帮助人们更好的理解C. lunata,并在此基础上开发更灵活的策略,控制其感染农作物。
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