中草药在贮存保管中，因受周围坏境和自然条件等因素的影响，常会发生霉烂、虫蛀、变色、泛油等现象，导致药材变质，影响或失去疗效。因此必须贮存和保管好中药材，以保证药材的质量和疗效。
（一）药材的防霉：大气中存在着大量的霉菌孢子，如散落在药材表面上，在适当的温度（25℃左右）湿度（空气中相对湿度在85％以上或药材含水率超过15％）以及适宜的环境（如阴暗不通凤的场所）、足够的营养条件下，即萌发成菌丝，分泌酵素，分解和溶蚀药材使药材腐坏，以及产生秽臭恶味。
因此，防霉的重要措施是保证药材的干燥、人库后防湿、防热、通风，对已生霉的药材，可以撞刷、晾晒等方法简单除霉，霉迹严重的，可用水、醋、酒等洗刷后再晾晒，也可在库房内配备些除湿设备比如：除湿器、去湿机、杭州抽湿机、杭州除湿机。
（二）药材的防虫： 虫蛀对药材的影响甚大，虫害的预防和消灭，对于大量贮存保管的药材仓库，主要是用氯化苦、磷化铝等化学药剂熏蒸法杀虫。对于药房中小量保存的药材，除药剂杀虫外，可采用下列方法防虫。
1．密封法：—般按件密封，可采用适当容器，用蜡或血料封固，怕热的药材可用干砂或稻糠埋藏密封，贵细药材，可充二氧化碳或氮气密封。
2．冷藏法：温度在5℃左右即不易生虫，因此可采用冷窖、冷库等干燥冷藏。
3．对抗法：这是二种传统方法、适用于数量不多的药材。如泽泻与丹皮同贮、泽泻不生虫、丹皮不变色，蕲蛇中放花椒，鹿茸中放樟脑，瓜蒌、蛤士蟆油中放酒等均不生虫。
