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miRNA测序服务

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更新时间:2018-08-16 14:35:04浏览次数:1744次

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miRNA测序服务首先,microRNA(miRNA)是一类内生的、长度约为20-24个核苷酸的小RNA,其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个miRNA可以有多个靶基因,而几个miRNA也可以调节同一个基因,这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达,也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某个基因的表达。大量的研究结果表明,miRNA在正常发育过程以及疾病发生过程中具有重要

三、技术优势:

1、高通量,低成本:一次测序可得到数百万条序列,单次运行可经济分析多个样品;

2、高分辨率:基于高通量测序技术能够直接从单核苷酸水平研究小分子RNA,不存在传统芯片杂交的荧光模拟信号带来的交叉和背景噪音问题,非常有利于区分相同家族以及序列极为相似的不同sRNA;

3、高精准度:reads能覆盖sRNA全序列,可成功检测低丰度表达的miRNA;

4、通用平台,不依赖已知信息:可进行任何物种的sRNA序列测定,既能鉴定已知的miRNA,又能预测新的miRNA;

5、可重复性高:深度测序保证了抽样随机性,重复性非常好,无需重复实验

四、样本要求:

1、样品类型:完整且无污染的总RNA;

2、样品需求量(单次):≥10 μg;

3、样品浓度:≥200 ng/μL;

4、样品纯度:OD260/280 =1.8~2.2;OD260/230≥2.0;28S:18S≥1.5;RIN≥8.0;23S:16S≥1.5 (此项要求只针对原核生物)。

五、成功案例:

【案例一】:采用新一代测序技术分析浸水24小时后的玉米种子的小RNA文库,进一步分析确认了115个已知miRNA属于24个miRNA家族,并发现了167个新的玉米miRNA。使用同样的方法,再次建立小RNA文库,将获得的已知miRNA和新发现miRNA的信息与重新构建的小RNA文库进行比对,成功推测出106个新miRNA的候选靶标。研究结果显示:玉米浸水种子中存在着miRNA媒介的基因表达调控。

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