高性能气相色谱仪是根据载气运动时气固或气液两相之间的吸附或分配系数的不同来分离样品中各组分的仪器。分离出的成分按照保留时间的顺序进入检测器，检测信号被自动记录。根据组分的保留时间和响应值进行定性和定量分析，主要由气源、气路控制系统、进样系统、色谱柱、检测器、电气系统和记录处理系统组成。
高性能气相色谱仪调试完毕后，根据各单体的规定条件，调整气相色谱仪的柱管、气相色谱仪检测器、温度和载气流量。进样口的温度一般应比色谱柱温度高30-50。如果使用火焰离子化检测器，其温度应等于或高于色谱柱温度，但不得低于100，以避免水蒸气冷凝。色谱分析成分的峰位置用保留时间(从进样液体到成分出现高峰的时间)和保留容量(保留时间载气流速)表示。在某些条件下，这些可以反映物质特殊价值并相应地确定样品的组成。
高性能气相色谱仪经过加热以后，要检查色谱柱的连接情况和支架的固定是否牢固。以免由于温度、振动等原因使色谱柱受挤压或折断。柱子折断以后，请不要扔掉。若折断的是两端，长的一部分在一定范围仍然可以得到很好的分离效果。如果折断的是中间，经过一定程度的修复以后，仍然可以恢复使用功能。
当污染严重时，必须移除探测器进行清洁。该方法是除去收集器、极化电极、喷嘴等。如果喷嘴由应时材料制成，将其浸泡在水中过夜。如果喷嘴由不锈钢，等材料制成，可以用300~400号细砂纸连同电极一起仔细打磨，喷嘴顶部穿入一个特殊的清洁细线束，插入并拉出数次，直到导线能够平稳移动。然后用适当的溶剂(如1:1甲醇和苯)浸泡。也可以用超声波清洗机清洗，用色谱级甲醇清洗，并在烘箱中干燥。
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