对于种子计数工作来说，传统的计数方式存在效率低下的弊端，因此现在多是使用效率更高的自动种子计数器。
在种子的品种选育过程中，对种子的计数是*的内容。而如果在计数工作上耽误大量的时间，或者是因为种子计数不准确，都会影响试验的进行，因此现代研发的自动种子计数器主要目的就是避免这些为题对于品种选育工作的影响，从而为现代农业工作作出一份贡献。
而在种子的发芽率测定试验中，自动种子计数器也有重要的应用，比如种子发芽率大于95%，并不是说100颗种子一定发芽多于95颗种子！这里所谓的发芽率大于95%，是指用大量种子做大量实验时，发芽的种子占总种子的百分比。而要对这些大量中字技术，很明显人工计数的方式是非常吃力而且落后的，这个时候就需要用到自动种子计数器。
而且现在的自动种子计数器与以往的种子计数器相比，在技术上又上升了一个台阶，它是根据图像识别原理并且能实现自动分析，统计报表。 在现代，广泛应用于对种子测产及考种任务中。
