离心机在微生物学诊断工作上，常被用作从被检物料中分离出被检微生物，并得到纯培养(即单个一种微生物的培养物)。所以，一般要使用离心机对样品开展离心分离，微生物的离心机分离培养方式是微生物学诊断中的一种关键操作方法。
分离单一微生物的方式有很多，常见的有下列几种：
1、将被检物料接种于适合微生物培养基，再于固体培养基表层生成的菌体中，选样欲分离菌的单个菌体，移种于另一个适合微生物培养基中培养。由于1个菌体一般由1个细菌生成繁衍所产生，故培养出的细菌是单一的类型，即纯培养。
2、用的培养环境(如厌氧、二氧化碳环境等)分离细菌。
将被检物料接种子易患动物身体内，使病原菌在动物身体内繁衍，随后从动物身体内取物料运用离心机开展离心分离出需用的成份后培养。运用某一些细菌对一部分理化要素有抵抗力，用理化方式处置接种物料，杀掉其它微生物而保留需用的细菌，再分离培养。
通常情况下，被检物料用前两种方式分离培养即可。如披捡物料污染比较严重，可首先用后两种方式处置，再用前两种方式得到纯培养。
在分离培养操作中，严格执行无菌操作。全部用品、微生物培养基、试剂必须通过杀菌，并且不可以长期暴露于空气中。严禁拿手触碰或用口吹已杀菌的器皿內部。
按照被检物料中也许 存有的病原苗的特点，选取恰当的微生物培养基和培养条件：(温度、气体环境等)。开展不明菌的初次分离，是多使用几种微生物培养基，如肉汤、鲜血琼脂、麦康克琼脂等，每一种微生物培养基接种数管，分別放到普通环境和厌氧环境中培养。通常通过24—78小时观察結果，但还有一部分病原菌，需用培养较长时间才可以生成。
被检物料通常无需处置，可以直接按种于微生物培养基上。当怀疑为有芽脑的病原苗时，可将被检物料加生理盐水磨碎，制成1：10乳剂(液体物料无须稀释)，置60-80℃水浴中20—30分钟，以杀掉无芽胞的杂菌，随后再接种于微生物培养基中。
