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上海博湖生物科技有限公司
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定量PCR实验过程注意事项
2023-9-25 阅读(391)
在定量PCR(也称rt-PCR或qPCR)中,荧光信号是由荧光探针或荧光DNA结合染料(如SYBR Green)产生,其强度与PCR产物分子(扩增子)的数量成正比。每个循环结束时,收集荧光信号强度,通过将荧光强度与循环数作图,qPCR仪生成扩增曲线,其表示在整个PCR过程中产物的累积,通过这个过程,即可实现量化。如果样品中特定的序列(DNA或RNA)丰富,则在较早的循环中观察到扩增,Ct值小;如果序列稀少,则在稍后的循环中观察到扩增,Ct值大。此SOP将涵盖总RNA提取和两步法逆转录定量PCR(qRT PCR)的操作过程以及数据分析。
注意事项:
1、 所有步骤均应在超净工作台上进行,超净台紫外照射至少15min。
2、所有试剂应为此实验专用。
3、使用75%乙醇或其他去污剂擦拭工作台,避免表面污染。
4、 进入荧光定量PCR 操作实验室后需要佩戴一次性无菌口罩、无菌乳胶手套、实验中尽量避免与同事交谈,防止PCR 模板污染。
5、实验中使用各种规格的离心管,枪头及配制试剂和溶解沉淀用的水,均应焦碳酸二乙酯(DEPC)处理后使用,以去除吸附的RNA酶污染。
6、 使用Trizol试剂时,避免接触皮肤或衣服。避免吸入蒸气。
7、qPCR反应需要qPCR级水,试剂和试管。请务必使用正确类型的qPCR光学PCR管和盖子。不可用普通的PCR管。
8、加样前,先布局,规划加样顺序以避免交叉污染。
9、所有实验应均应设置无模板对照,其中包含除DNA或cDNA样品以外的所有反应组分。
10、先配制qPCR反应混合液,减少误差。
11、 加样后上机前,务必通过瞬离将反应液离至管底,并消除溶液中的气泡,因为气泡会干扰荧光检测且降低酶活性,从而降低扩增效率。