制药工业废水主要包括抗生素生产废水、合成药物生产废水、中成药生产废水以及各类制剂生产过程的洗涤水和冲洗废水四大类。其废水的特点是成分复杂、有机物含量高、毒性大、色度深和含盐量高，特别是生化性很差，且间歇排放，属难处理的工业废水，如何处理该类废水是当今环境保护的一个难题。
       常规的制药废水处理工艺主要有物理技术、化学技术、生物技术等工艺。
       由于制药废水中含有大量的有机污染物,所以制药废水的水质特点使得多数制药废水单独采用生化法处理根本无法达标， 所以在生化处理前必须进行必要的预处理。
物理处理技术
       物理处理技术是指应用物理作用来分离废水中的溶解物质或乳浊物改变废水成分的处理方法，如格栅(筛网)、沉淀(沉砂)、过滤、微滤、气浮、离心(旋流)分离等单元操作，已成为废水处理流程的基础，目前已较为成熟。
化学处理技术
       化学处理技术是应用化学原理和化学作用将废水中的污染物成分转化为无害物质，使废水得到净化的方法，其单元操作过程有中和、沉淀、氧化还原、催化氧化和焚烧等。
生物处理技术
       生物处理技术是一般有机废水处理系统中最重要的过程之一，是利用微生物，主要是细菌的代谢作用，氧化、分解、吸附废水中可溶性的有机物及部分不溶性有机物，并使其转化为无害的稳定物质从而使水得到净化的技术。在现代的生物技术处理过程中，主要有好氧生物氧化、兼氧生物降解及厌氧消化降解被广泛应用，生物处理技术由于经济可行、无二次污染等特点，已越来越引起重视。

制药废水处理工艺的特点：
       物理法具有污染物去除率高、设备运行费用低等特点；
       化学处理技术法具有操作及调控技术简单、处理效果明显等优势，适用于短时间、应急状态下处理；
       生物方法的主要特点是在特定的生化反应器中，给予适当的反应条件，充分发挥好氧、厌氧微生物的代谢活性，实现对制药废水各类污染物的减量化、无害化。