医院污水消毒方法主要有以下三种：

（1）生物滤池消毒法：曝气生物滤池法是经过生物降解反应和过滤双重功能处理废水中的有机物，主要处理手术室、病房、化验室等部门排放有机污染物，使污水达到合理的氧化利用;但其工艺复杂、负荷过大、成本偏高，因此适合大型医院使用，处理效果较好。 

（2）臭氧添加剂：臭氧具有杀菌效果能够有效的去除医院污水中的细菌、微生物而且臭氧不会造成二次污染会在水中全部分解，因此广泛适用于杀菌污水中。

（3）二氧化氯消毒法：二氧化氯消毒法因其灭菌效率高达99%，而且不受水质酸碱度和氨及胺类化合物影响；因此被世界卫生组织（WHO）确认为高效强力杀菌剂，是上*的污水消毒更新替代产品，为国家环境保护总局所推荐。其处理方法简单、效果明显、成本适中，故而被广泛应用于医院污水消毒处理。

 

（4）次氯酸钠发生器消毒法：次氯酸钠是强氧化剂和消毒剂，它是通过取源于广泛价廉的工业盐或海水稀溶液，经无隔膜电解而发生的。为确保次氯酸钠质地新鲜和有较高的活性。保证消毒效果，本装置一边发生，一边将发生的次氯酸钠投加使用。它与氯和氯的化合物相比，具有相同的氧化性和消毒作用。次氯酸钠发生器主要用于医院含菌污水处理，电镀含氰废水的处理，还可用于游泳池、生活饮用水、生活污水消毒、食品加工厂环境和医疗器械、饮食店、公共食堂的餐具和饮具消毒。