化学兼容性是指两种物质相互接触时的和谐共轭作用。通过考虑一种物质与另一种物质混合时的稳定性来进行测量。在混合时，如果元素没有显示变化，则它们被认为是相容的，而如果物质发生物理或化学变化(如果变化对所需结果产生不利影响)，则认为它们是化学不兼容的。化学兼容性是过滤过程中重要的因素。在过滤液体，气体或空气时，需要考虑过滤材料的成分。过滤器的材料应与被过滤液体的化学性质兼容。这样可以减少过程中发生故障的风险。通常观察到与液体有关的化学兼容性，但是溶解的溶质可能会不希望地与滤液介质混合。因此，应让过滤介质对特定物质敏感或有抵抗力。应注意不要因化学暴露而对介质造成损害。只有发现它们兼容，才可以继续进行过滤过程。
兼容性受许多因素影响，例如暴露时间长短，浓度，温度和施加的压力。这些因素单独地或组合地能够影响过滤过程。在有机溶剂的情况下，这些因素很重要。过滤器的介质应耐溶剂。否则对过滤那些溶剂没有作用。同样，如果溶剂化学侵蚀过滤器，或者如果过滤器经历了化学降解，则它可能会将污垢元素释放到料流中，因此对于所有实际目的都是无用的。
此外，某些溶剂不会破坏过滤器，但会被聚合物基质吸收，因此会改变孔径并改变过滤器的性能以备将来使用，从而从长远来看会影响其使用寿命和效率。在过滤水溶液的情况下，可能发生类似的情况。因此，应注意，袋式过滤器不会因水流而遭受损坏。应测试化学添加剂，pH平衡以及酸和碱，以确定不同因素对过滤介质的影响并理解过滤器的灵敏度。
