在目前的废水处理现状中，对次氯酸钠的应用主要分为两种情况。
 

　　首先是通过利用次氯酸钠或者次氯酸钙等进行药剂投用，来进行专业化的医疗废水处理。这种处理方式运行成本低，且操作简便，因此在小型医疗机构中应用较为广泛，并且产生较好的效果。但是这种处理方式通常局限于人数较少的医疗结构，并且污染成分并不复杂的情况。并且由于整个过程需要依赖于人工操作，因此存在着较大的不确定性，很难保证处理效果。
 

　　其次通过利用次氯酸钠的自动生成设备，来进行自动化处理，并对药剂进行自动化计量。通过应用这样的处理方式，可以实现自动化的废水处理，并保证整个处理过程的连续性，同时还可以通过药剂计量的调整，来形成针对性的处理效果，使废水中的相关污染成分被有效消灭。但是这种处理方式会产生较大程度的能源消耗，不仅会产生电量消耗，同时还会产生一定程度上的盐耗，从而在无形之中增加了运行成本。经过长时间使用，相关设备将会产生强烈的腐蚀，需要专职人员做好针对设备的维修以及相应的管理工作，这同样会造成处理成本的增加。综上所述，如果医疗机构规模相对较大，患者数量相对较多，并且会产生大量的医疗废水，废水成分相对复杂，通过对这种方式的利用，可以产生较好的效果。