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PCR的循环参数具体介绍

时间:2022/10/17阅读:2423
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   PCR反应循环参数是指在聚合酶链式反应中,循环参数中退火温度和时间、延伸时间及PCR缓冲液的成分影响多重PCR的扩增效果,而反应体积、循环次数对其扩增效果影响较小。多重PCR(mutiplex PCR)技术因具有高效、高产率、能降低实验成本、加速实验进程等优点,要求不同引物能在同一反应体系中进行特异性扩增, 因而影响其扩增效果的因素较多, 主要有循环参数、反应体积、反应体系、引物间的碱基配对等 。PCR的循环参数具体介绍:

 
1.  预变性(Initial denaturation)

模板DNA*变性与PCR酶的*激活对PCR能否成功至关重要,建议加热时间参考试剂说明书,一般未修饰的Taq酶激活时间为两分钟。

2.  循环中的变性步骤

循环中一般95℃,30秒足以使各种靶DNA序列*变性,可能的情况下可 缩短该步骤时间,变性时间过长损害酶活性,过短靶序列变性不*,易造成扩增失败。

3.  引物退火(Primer annealing)

退火温度需要从多方面去决定,一般根据引物的Tm值为参考,根据扩增的长度适当下调作为退火温度。然后在此次实验基础上做出预估。

退火温度对PCR的特异性有较大影响。

4.  引物延伸

引物延伸一般在72℃进行(Taq酶最适温度)。但在扩增长度较短且退火温度较高时,本步骤可省略

延伸时间随扩增片段长短而定,一般推荐在1000 bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生设定为1 min/kbp。

5.  循环数

大多数PCR含25-40循环,过多易产生非特异扩增。

6.  最后延伸

在最后一个循环后,反应在72℃维持5-15分钟.使引物延伸*,并使单链产物退火成双链。


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