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类器官蛋白提取方法:
一、试剂准备(细胞浆、细胞核及细胞膜蛋白抽提试剂盒)
1、准备溶液
1)室温融解试剂盒中的各种溶液,溶解后除结构蛋白提取液外,其他试剂立即置于冰上;
2)结构蛋白提取液溶解后,可放置于37℃水浴中温浴至透明后,常温放置。
2、蛋白提取工作液的准备
1)胞浆蛋白提取工作液的准备:临用前,根据处理样品的量估算实验时胞浆蛋白提取液的需要量,并分别按照1:50比例加入磷酸酶抑制剂II和1:100比例加入蛋白酶抑制剂PMSF;
2)胞核蛋白提取工作液的准备:临用前,根据处理样品的量估算实验时胞核蛋白提取液的需要量,并分别按照1:50比例加入磷酸酶抑制剂II和1:100比例加入蛋白酶抑制剂PMSF;
3)膜蛋白提取工作液的准备:临用前,根据处理样品的量估算实验时膜蛋白提取液的需要量,并分别按照1:50比例加入磷酸酶抑制剂II和1:100比例加入蛋白酶抑制剂PMSF;
4)结构蛋白提取工作液的制备:临用前,根据处理样品的量估算实验时结构蛋白提取液的需要量,并分别按照1:50比例加入磷酸酶抑制剂II和1:100比例加入蛋白酶抑制剂PMSF。
二、类器官收集及洗涤
1、类器官收集
移液器吸去培养基,每孔添加1-2mL左右4℃类器官传代培养缓冲液(abs9730),轻柔吹打基质胶,收集在15mL离心管中(24孔板,每5孔为一组),4℃静置10min或-20℃放置5min(目的是使基质胶软化),300g ,4℃, 离心5min弃上清。
2、类器官清洗
添加1mL类器官传代培养缓冲液重悬,300g ,4℃,离心5min弃上清。
三、类器官蛋白提取
1、胞浆蛋白提取
1)向含类器官沉淀的EP中加入2mL的胞浆蛋白提取工作液,在4℃条件下震荡20min;
2)准备1-5mL的注射器,用注射器吹打步骤1震荡过的溶液50-90次,在4℃条件下,15000g离心10min。取上清液存于EP管中,即为胞浆蛋白。
2、胞核蛋白的提取
取3.1.2步骤获得的沉淀物加入4mL冰浴的胞浆蛋白提取工作液,在4℃条件下震荡5min,4℃条件下15000g离心10min,弃去上清液,沉淀物中加入1mL冰冻的胞核蛋白提取工作液,在4℃条件下震荡5min,4℃条件下15000g离心10min,上清液为细胞核蛋白,转入EP管并保存。
3、胞膜蛋白的提取
在步骤3.2中的沉淀物中加入1mL冰冻的膜蛋白提取工作液,在4℃条件下震荡5min,4℃条件下15000g离心10min,上清液为细胞膜蛋白,转入EP管并保存。
4、结构蛋白的提取
在步骤3.3的沉淀物中加入常温或37℃水浴过的透明的结构蛋白提取工作液0.5mL,4℃条件下震荡5min,4℃条件下15000g离心10min,保存上清液即为细胞骨架蛋白。
5、待测蛋白的保存待检测浓度的蛋白存于-70℃,可以用于Western,EMSA,footprinting,报告基因检测以及酶活力测定等后续操作。
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