污水处理系统与一般设备操作不同，当系统刚刚建立或经长时间停用后需重新投入运行时，必须经过系动启动工作方能投入正常运行，下面就系统启动等需注意有关事项进行描述，以指导操作人员正确使用本系统装置。

1、系统启动前之检查 操作人员于系统启动之前应检查下列各项：
(1) 各项设备是否均润滑完毕。
(2) 检查各管道及阀门是否连接完善。
(3) 确认电力及自来水系统，并将 MCC 盘上所有之开关置于接通位置。
(4) 检查药槽中之化学药剂。
(5) 检查 PLC 之程式时间设定。
(6) 再次参考单机试车之报告。

2、污泥培养启动生物处理系统首要步骤是培养数量足够的细菌族群(污泥)并加以驯化，以便能够有效处理废水，当污泥尚未适应废水性质且数量不足以分解废水中有机污染物之前，处理出水往往不能达到设计排放标准。因此尽可能在短时间内使得污泥数量达到设计要求就成为启动生物处理系统首要步骤。
虽然在污水中适当的细菌族群可以自然生长且增加数量，但通常需要一段相当长的时间，因此根据实际情况，或通过进入污水直接培养，或直接从其它污水处理厂“接种”污泥至新建系统为有效缩短污泥培养时间的很好的方法。在试运行阶段，进入处理装置的污水，水量和水质均无法达到设计要求，因此，在这段时间内，应足以培养系统中的生物膜量。