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如何利用在线资源研究癌症基因组

时间:2012-3-8阅读:498
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 癌症基因组研究无疑已成为癌症研究领域的一大热点,而且这种研究技术无需研究人员十分扎实的生物信息学基础,就能获得*——癌症研究人员已经积累了不少小突变,拷贝数变异,表观遗传学变化,表达水平差异的分析数据,以及大量癌症类型的临床特征数据,早在2008年科学家们就公布了*癌症基因组序列(急性髓细胞白血病)。

这意味着目前进入这一领域研究的相关科研人员将能获得更多,更高质量的信息,当然研究分析不是一件容易的事情,正如Dana Farber癌症研究所的副教授William Hahn所说的那样,“要想了解这些信息,并掌握如何运用的方法,是一个巨大的挑战。”
近期生命科学期刊The Scientist杂志以“Combing the Cancer Genome”为题,介绍了癌症基因组研究中一些有效的在线资源,以及如何运用,可谓是这方面研究的指引手册。
文章指出,目前可获取的基因组数据来自几个大型合作组织,癌症基因组图谱研究计划(Cancer Genome Atlas pilot program,TCGA)就是其中一项,这是一项由美国国立癌症研究所和美国国家人类基因组研究合作进行的项目,于2005年晚期启动,目标是“测试一种大规模、系统性分析癌细胞基因组变化的方法的可行性”,为检测、治疗、预防癌症提供基因组信息。
 

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