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百萤课堂之DNA定量试剂盒的实验方案

时间:2023/11/3阅读:89
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高灵敏度荧光的DNA定量试剂盒针对CytoCite和Qubit荧光分析仪进行了优化。DNA定量是用于各种基因组分析的DNA样品制备中非常重要的。 这种Portelite dsDNA定量试剂盒提供了一种使用手持式荧光分析仪使用Helixyte Green探针定量dsDNA的快速方法。 它针对Cytocite 和Qubit 荧光计进行了优化。 Portelite dsDNA定量分析线性超过五个数量级。 该测定法对RNA上的双链DNA(dsDNA)具有高度选择性,并且设计为对于25pg / uL至100ng / uL的初始样品浓度是准确的。 Helixyte Green在与dsDNA结合后表现出大的荧光增强,并且比UV吸光度读数更敏感。

 

一.百萤DNA定量试剂盒适用仪器

 

量子位荧光计

Ex:  480nm

Em:  520nm

规格:0.2mL PCR小瓶

 

CytoCite荧光计

Ex:  480nm

Em:  520nm

规格:0.2mL PCR小瓶

 

二.百萤DNA定量试剂盒实验方案

 

溶液制备

Helixyte Green 工作溶液制备:
为10个样品制备足够的工作溶液,将10μL Helixyte Green (组分A)加入2 mL DNA分析缓冲液(组分B)中。 注意:用铝箔覆盖或将其置于黑暗中,以保护工作溶液免受光照。 注意:我们建议将此溶液用塑料容器而不是玻璃制备,因为染料可能会吸附到玻璃表面。 为获得佳效果,该溶液应在其制备后几小时内使用。

 

样品实验方案

样品体积是1~20μL(取决于DNA样品的估计浓度)。推荐样品体积为10μL,DNA浓度范围为0.5~10 ng /μL。如果使用其他样品量,请在浓度计算中调整稀释倍数。


1.基于10μL样品体积生成以下方案,DNA浓度在0.5~10 ng /μL范围内。

1.1在每个Cytocite 样品管(#CCT100)或等效的0.2 mL PCR管中加入190μL1XHelixyte Green 工作溶液注意:使用薄壁聚丙烯,透明的0.2 mL PCR管,如#CCT100。

1.2将DNA标准品或测试样品10μL加入每个试管中,然后涡旋混合2~3秒。

1.3让所有试管在室温下孵育2分钟。

1.4将样品插入CytoCite 或Quibit ,并用绿色荧光通道监测荧光。按照适用于CytoCite 荧光分析仪的步骤进行操作。

 

2.标准校准曲线的制备

对于Portelite 分析,您可以选择使用DNA标准制作校准曲线。 以下是生成定制DNA标准曲线的简要方案:

2.1用DNA Assay Buffer进行稀释,得到10,8,6,4,2,1,0.5,0 ng /μLDNA标准稀释液。

2.2将190μLHelixyteGreen 工作溶液加入0.2 mL PCR管中。

2.3每管加入10μL标准品或10μL样品。

2.4在室温下孵育反应2分钟。

2.5将样品插入CytoCite 并用绿色荧光通道检测荧光。

 

数据分析

从空白标准孔获得的读数(RFU)用作阴性对照。 从其他标准的读数中减去该值,以获得基线校正值。 然后,绘制标准读数以获得标准曲线和方程。 该等式可用于计算浓度样本。

image.png

图1.使用Portelite 荧光DNA高灵敏度定量试剂盒生成的DNA标准曲线。 使用FITC通道定量荧光强度,使用log-log best-fit计算回归模型。 检测限为10 pg /μL。

 


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