固相萃取填料从预处理到样品加入时都保持湿润，允许大约1毫升的预处理溶剂在管过滤片(frit)或萃取片表面之上。如果样品是从一个贮液管或过滤管引入固相萃取管，则多加入0。5毫升zui后的预处理溶剂到1毫升的固相萃取管中，如果是2毫升到3毫升的萃取柱中，多加入4升到6毫升管中等等。这是为了保证在样品加入之前萃取柱湿润。如果在样品加入之前，萃取柱中的填料干了，重复预处理过程。在重新引入有机溶剂之前，用水冲洗柱中缓冲溶液的盐。甲醇湿润吸附剂表面和渗透键合烷基相，固相萃取柱以允许水更有效地湿润硅胶表面。有时前预处理溶剂使用在甲醇之前。这些溶剂通常是与洗脱溶剂一样，是用之消除固相萃取管上的杂质及其对分析物的干扰，也可能该杂质只溶于强洗脱溶剂。
 
固相萃取应用于处理液体样品，用来萃取、浓缩和净化样品中的挥发性和半挥发性化合物;当需要用于固体样品时，须先把固体样品处理为液态。固 相萃取SPE的应用十分广泛,如生物液体包括血液、尿液、血清和血浆及细胞质的分析;牛奶处理、酒类、饮料及果汁分析;水资源的分析与监控;果蔬谷物及各 种植物组织和动物组织;药片等固体药物;水中多环芳烃、多氯联苯等有机物分析，果蔬、食品中农药和除草剂残留分析，抗生素和临床药物分析。当样品溶液通过吸附剂床时，分离物在吸附剂上不移动。固相萃取柱保留是三个因素的作用：分离物、溶 剂和吸附剂。所以，一个给定的分离物的保留行为在不同溶剂和吸附剂存在下是变化的。