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DNA拓扑异构酶
点击次数:472 发布时间:2013-8-20
DNA拓扑异构酶的概念
DNA拓扑异构酶为催化DNA拓扑学异构体相互转变的酶之总称,催化DNA链断开和结合的偶联反应。
DNA拓朴异构酶的分类
按照拓扑异构酶将闭环状双链DNA异构体化的方式,拓扑异构酶可分为两种方式:
DNA拓扑异构酶
Ⅰ型拓扑异构酶(top-oisomeraseⅠ):切断一个链而改变DNA的拓扑结构的异构化方式,属于此类的有如大肠杆菌的ω蛋白(ω-protein,由分子量11万的单个多肽链所成)及各种真核细胞中存在的切断-结合酶(nicking-closing enzyme,分子量约6万5千—7万的及分子量约10万的)。Ⅰ型拓扑异构酶不需要ATP的能量而催化异构体化,作为反应的中间产物,在原核生物来说是游离型的5′-OH末端扣3′-磷酸末端与酶形成共价键,而真核生物是3′-OH末端5′-磷酸末端与酶形成共价键。此酯键中所贮存的能量,可能在切断端的再结合上起着作用。Ⅰ型拓扑异构化酶催化的反应有下列各种:使超螺旋DNA在每一切断—结合反应中,使L数(参见DNA拓扑学异构体)发生一种变化,即松弛(relaxation)(图1)。将互补的单链环状DNA转变成具有螺旋结构的双链环状DNA(图 2),使单链DNA打结(topological knot)或解结(图3)。另外在二个环状双链DNA一个分子的一个链切断时,形成链环状二聚体的分子(ca-tenane)。真核细胞的拓扑异构酶Ⅰ,参与核小体的形成,细菌的ω蛋白参与转录和某种转位子的插入。
Ⅱ型拓扑异构酶(top-oisomeraseⅡ):通过切断DNA的两条链来进行拓扑异构化。Ⅱ型拓扑异构酶,有存在于细菌中的DNA促旋酶、噬菌体T4的拓扑异构酶Ⅱ以及真核细胞中依赖ATP的拓扑异构酶Ⅱ等。在Ⅱ型拓扑异构酶中,DNA促旋酶可单独催化闭环状DNA产生超螺旋,这是*的。其它二个型的酶,除可使超螺旋松弛也需要ATP的能量外,还可催化促旋酶的催化反应。促旋酶和T4拓扑异构酶Ⅱ参与DNA的复制和转录过程。
另外,噬菌体λ的irt基因产物和噬菌体φX174的基因A的产物等也具有切断—结合酶的活性,可认为是拓扑异构酶之一种。