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技术讲解:λ噬菌体DNA提取方法

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λ噬菌体是zui早使用的克隆载体,λ噬菌体的基因组是一长度约为50kb的双链DNA分子,它在宿主细胞有两种生活途径,其一是裂解生长,环状DNA分子在细胞内多次复制,合成大量噬菌体基因产物,装配成噬菌体颗粒,裂解宿主菌再进行下一次感染;其二是溶源性生长,即感染细胞内λ噬菌体DNA整合到宿主菌染色体DNA中与之一起复制,并遗传给子代细胞,宿主细胞不裂解。平板培养时,裂解生长形成噬斑。液体培养时,裂解生长使菌液中宿主菌zui后全部被裂解而释放出大量的噬菌体颗粒。经过改造的λ噬菌体克隆位点可插入几到几十kb的外源DNA。许多cDNA和基因组文库是以λ噬菌体作为克隆载体构建的。因此,在经文库筛选得到目的克隆后,我们常常需要利用λ噬菌体裂解生长的特点,培养获得大量的噬菌体颗粒,并提取λ噬菌体DNA来开展进一步的工作。

一、试剂准备

1. LB液体培养基:胰化蛋白胨(细菌培养用)10g,酵母提取物(细菌培养用)5g,NaCl 10g,加ddH2 O 至1000ml,*溶解,分装小瓶,15lbf/in2高压灭菌20min。

2. 1.5%琼脂LB固体培养基:称取1.5g琼脂粉放入300ml锥形瓶,加100mlLB,15 lbf/in2 高压灭菌20min,稍冷却,制备平皿。

3. 20%麦芽糖:麦芽糖20g,加ddH2O 至100ml,0.22μm滤膜过滤。

4. SM液:NaCl 5.8g,MgSO4·7H2O 2g,1M Tris·CL(PH7.5)50ml,2%明胶 5ml,加ddH2O 至1000ml。15lbf/in2高压灭菌20min。

5. RNase A 10mg/ml,TE配制,沸水浴15min,分装后贮存于-20℃。

6.DNase I 10mg/ml,TE配制,分装后贮存于-20℃。

7. PEG 8000

8. 10%SDS

9.EDTA: 0.5M pH8.0

10. /氯仿/异戊醇(25:24:1)

11. 异丙醇

12. 无水乙醇、70%乙醇

二、操作步骤

1. λ噬菌体平板培养

① 用SM液10倍梯度稀释λ噬菌体原种。

② 取0.1ml各梯度稀释离心到一消毒微量离心管中,加0.2ml新鲜培养的宿主菌,加麦芽糖(0.2%),MgSO4(10mm),37℃温育20min,使噬菌体颗粒吸附于细菌。

③ 取熔化(47℃)0.7%琼脂LB固体培养基3ml与上述管混匀,立即倒入预备(2-4天)的含凝固1.5%琼脂LB固体培养基的平板内,轻轻晃动平板使均匀分布。

④ 37℃培养6-8hr后,观察噬斑形成。

⑤ 用剪去部分头部的吸头挖取单个噬斑到0.5ml的SM液中,加0.05ml氯仿,震荡。37℃温育10min。

⑥ 重复⑴-⑷,获得单个噬斑滴度。

2. λ噬菌体液体培养

① 取2ml新鲜培养的宿主菌,离心,0.4ml LB培养基重悬,加λ噬菌体0.1ml(新鲜获得的单个噬斑,依滴度使之与宿主菌比约1/500-1000)。

② 加麦芽糖(0.2%),MgSO4(10mM),37℃温育20min,使噬菌体颗粒吸附于细菌。

③ 加到100ml LB液体培养基中,加麦芽糖(0.2%),MgSO4(10mM),37℃摇震培养9-12hr后可见裂解发生。

④ 加0.1ml氯仿,37℃继续摇震培养10-20min。

二、λ噬菌体DNA提取

1. 将上述裂解液转移至离心管,离心8000g×10min,去细菌碎片,取上清液。

2. 加RNase A、DNaseI 至1μg/ml, 37℃温育30min。

3. 加9.3g PEG 8000,5.8g NaCl,摇匀至溶解,冰浴1hr或4℃过夜。

4. 4℃离心10000g×20min,去上清液。

5. 加2ml SM液,充分洗溶管壁及沉淀,移到新微量离心管,加20μl 10%SDS,20μl 0.5M EDTA,68℃15min。

6. 加等体积/氯仿/异戊醇(25:24:1),混匀,离心12000g×5min,取上层液到一新微量离心管,加等体积氯仿/异戊醇(24:1),混匀,离心12000g×5min。

7. 取上层液到一新微量离心管,加等体积异丙醇,混匀,-20℃1hr,4℃离心12000g×10min,去上清液。

8.1ml预冷的70%乙醇洗涤沉淀1-2次,4℃离心8000g×7min,弃上清,将沉淀室温下晾干。

9. 沉淀溶于20μl TE,-20℃保存备用。

三、注意事项

1. 用于裂解的噬菌体、宿主菌为新鲜培养获得时,裂解好、裂解噬菌体收获量大。

2. 液体培养裂解时,如到培养时间时裂解尚未发生,可适当提高培养温度或加大摇震速度。

3. RNase A 、DnaseI消化不全,DNA、RNA可粘走部分噬菌体。

4. /氯仿抽提时,注意PEG、蛋白质等杂质污染,它们会影响限制性内切酶切割。
 

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