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基因型检测芯片试剂盒检测原理

点击次数:973 发布时间:2012-8-6

基因是脱氧核糖核酸(DNA)分子中含有特定遗传信息的一段核苷酸序列,是遗传物质的zui小功能单位。DNA结构中的单个碱基序列发生变异就构成了单核苷酸的多态性(SingleNucleotidePolymorphism,SNP)我们把包括SNP在内的不同基因结构称为不同的基因型。不同的基因型可以帮助解释不同的人种、人群、个体对疾病易感性的不同,以及对药物的不同反应能力等,在对病人的个性化治疗以及健康人的疾病预防上具有重大义!

基因型检测芯片试剂盒就是根据不同基因的SNP信息,利用*的基因芯片技术而研制的。

检测原理:基于生物样本中基因靶序列与固定有基因探针的基因芯片进行特异性杂交,经过酶促显色反应,给出待检基因的SNP信息的方法。

一.芯片制造原理:芯片制造原理DNA探针(寡核苷酸片段,与被检测的靶DNA互补)溶液与点样缓冲液以1:1比例混合[点样缓冲液可大大增加点样效果的稳定、提高检测灵敏度],通过点样仪点到醛基基片上,然后用芯片活化液固定[芯片活化液可使醛基修饰载玻片上醛基的活性增强,提高氨基修饰基因探针的固定效率]。固定后DNA探针将与醛基玻片共价结合,形成阵列;完成芯片制作过程。

二.抽提原理:抽提原理

通过向样本中加入抽提液,温浴、离心等操作,使样品中的细胞裂解,释放出DNA;同时使蛋白变性沉淀,完成样本DNA的抽提。DNA提取纯化试剂盒提取的DNA可以直接用于PCR扩增,无需酚和氯仿抽提,无需乙醇沉淀,具有时间短、操作简便、无毒无害的特点。

三.扩增液制造原理:扩增液制造原理

抽提获得的染色体DNA浓度太小,直接进行杂交检测无法获得信号。将抽提获得的染色体DNA作为模板,进行PCR扩增(同时对靶DNA进行标记),扩增产物的浓度足够杂交检测的需要。PCR的反应过程是将人工合成的两条寡聚核苷酸引物(两条短的DNA 片段)聚合酶和靶DNA经过一系列的升降温循环来扩增DNA,、寡聚核苷酸引物杂交到靶DNA上,为聚合酶(Taq酶)提供了延伸起始位点,然后在两个引物之间复制合成靶DNA序列。一个循环产生两个复制模板,两个循环产生四个复制模板,依次类推,PCR30循环就可以产生100万个靶序列的复制模板。因此只需从样本中抽提少量DNA,就可以进行基因芯片检测。百傲公司的扩增液就是依据PCR扩增原理制造的。针对各待检基因序列的SNP位点,设计20bp左右的上、下游引物用于扩增靶DNA,另外在引物一端连接*,用于显色识别。扩增液包含了

上下游引物以及PCR反应所需的各种试剂(如dNTP、Mgcl2、H2O、Buffer等)Taq酶另管提供。将扩增液中加Taq酶、抽提好的靶DNA通过PCR反应将靶DNA 片段迅速扩大,用于杂交和显色反应。

四.杂交显色原理:杂交显色原理

杂交原理:变性后的DNA扩增产物与基因芯片上探针进行特异性杂杂交原理交,就可以知道样本DNA序列中SNP信息,即到底是属于野生型还是突变型,是杂合子还是纯合子。基因芯片杂交反应是通过靶DNA与探针的互补碱基之间形成氢键而恢复成原来的双螺旋结构原理进行的。在杂交反应中,序列组成、靶标DNA分子和探针的长度、杂交温度、盐等均会影响杂交效率和强度。显色原理:采用Biotin标记的碱性磷酸酶(AP)催化的显色原理NBT/BCIP显色反应的检测方法。首先,与检测探针杂交的扩增产物上的Biotin先与链亲和素碱性磷酸酶复合物(Stripavitin-AP)反应,生成新的复合物:Biotin-Stripavitin-AP,后者发生如下的显色反应:Biotin-Stripavitin-AP+BCI-P→BCI-OH+PiBCI-OH+NBT→蓝紫色沉淀其中,BCIP为5溴-4氯-3吲哚磷酸;NBT为硝基四氮唑蓝。我公司自主研发的一系列用于杂交和显色的溶液(包括预杂交液、杂交缓冲液、洗液

1、洗液

2、洗液

3、抗体液和显色液)质量稳定,能有效提高基因芯片杂交反应和显色反应,排除非特异性杂交。

五.检测原理:检测原理(pH7.5)

采用CCD(ChargeCoupledDevice即电荷耦合器件)原理,将芯片上的色斑经信号放大,用BE-2.0基因图象分析软件(软件登记号:2002SR3064)进行分析,给出靶基因SNP信息。

 

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