酸性土壤是pH7的土值小于壤总称。包括砖红壤、赤红壤、红壤、黄壤和燥红土等土类。我国热带、亚热带地区，广泛分布着各种红色或黄色土壤的酸性土壤。当地气温高、雨量大，年降雨多在1500mm以上。这种高温多雨、湿热同季的特点，使土壤的风化和成土作用均甚强烈，生物物质的循环十分迅速。盐基高度不饱和，pH一般在4.5-6。同时铁铝氧化物有明显积聚，土壤酸瘦。可通过正确施肥，注意保持水土，改良土壤。可施用石灰，调节pH来减少某些重金属元素危害。东南丘陵地区的酸性红壤适宜种植茶树等碱性作物。
　　
　　酸性土壤（pH<5.5）在我国分布面积广泛，是我国热带亚热带粮食和经济作物的重要产地。一直以来，氨氧化细菌（AOB）被认为是土壤硝化作用的主要驱动者，但在多数酸性土壤中检测不到AOB，或发现AOB的存在与硝化作用无关，酸性土壤硝化作用的机理一直不够清楚。
　　
　　所谓的酸性土壤是指缺乏碱金属、碱土金属而大量吸附H+的pH<7的土壤，其酸性来源有：
　　
　　（1）雨水中的碳酸
　　
　　（2）微生物和植物根部代谢产物
　　
　　（3）有机物分解过程中产生的有机酸
　　
　　（4）硫化亚铁氧化生成的硫酸
　　
　　（5）化肥分解
　　
　　一旦形成酸性环境,吸附在粘土和腐植质上的碱性金属离子和H+替换而引起土壤中这些金属离子的缺乏,因此土壤呈酸性。
　　
　　*生态环境研究中心贺纪正研究员课题组于2007年在EnvironmentalMicrobiology上报道了酸性土壤中存在大量氨氧化古菌（AOA），且AOA的数量与土壤硝化潜势呈显著正相关关系，该成果在上引起关注，被SCI期刊广泛引用。zui近，他们利用稳定性同位素探针技术（SIP），结合经典的分子生态学手段，对我国强酸性土壤中的硝化作用机理开展了深入研究。
　　
　　根据氨氧化微生物氧化氨时进行化能自养生长固定CO2为碳源的牲征，研究人员在实验室微宇宙培养条件下，分别用13C-CO2和12C-CO2对酸性土壤进行标记培养，通过密度梯度超速离心，将结合了13C和12C的微生物DNA加以分离，并对这些DNA进行分子生物学分析，发现属于奇古菌门（Thaumarchaeota）中的氨氧化古菌（AOA）能固定13CO2，且其丰度变化与活跃的氨氧化速率呈显著正相关。在代表微生物多样性组成的DGGE指纹图谱上，两个AOA类群在培养后显著增加，而相应的氨氧化细菌则变化不明显，表明AOA是该酸性土壤硝化作用的主要贡献者。
　　
　　这一发现为AOA在酸性土壤硝化作用中发挥主导作用提供了直观证据，为重新认识酸性土壤中的硝化作用机理提供了重要参考。
　　
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