当前位置:南京森贝伽生物科技有限公司>>公司动态>>EMBO J:非编码小RNA可预测癌症
非编码小分子RNA可以预测出某个人是否患有乳腺癌,致力于癌症基因组图谱计划的研究人员得出这一结论。这一结果发表在《EMBO Reports》,指出特定类型的非编码RNA水平的差异可以用来区别癌和非癌组织。这些RNA也可用于把癌症患者分成具有不同的生存结果的亚群。
小非编码RNA是不产生蛋白质的RNA分子,但在细胞中也有其它重要的功能。“多年来,由于其明显的混沌分布以及无法将这些分子与已知功能或疾病相关联,转录起始位点附近的非编码小分子RNA被视为‘转录噪音’”加拿大西蒙弗雷泽大学和不列颠哥伦比亚大学教授,加拿大卑诗省癌症研究中心杰出的科学家,该研究的牵头作者Steven Jones说。“通过使用计算方法来分析我们生成的小RNA序列信息(癌症基因组图谱计划的一部分),我们已经能够通过过滤这个“转录噪音”,发现临床上有用的信息,”Jones补充说。“我们的实验数据表明,蛋白质编码基因的*个外显子的小非编码RNA在表达水平中的全基因组变化与乳腺癌相关。”
科学家们能够区分健康人和乳腺癌患者的基因转录起始位点附近的众多不同的小非编码RNA。他们确定这些RNA分子在DNA序列的特定位置,并寻找被强烈表达的非编码RNA与乳腺癌患者的相关性。然后,研究人员测试在基因组位置上表达的小RNA,是否可以用来从另一组已知具有乳腺癌的患者组织样本中预测疾病。“预测癌症的可能性被限制在基因的转录起始位点附近发现的,许多小的、非编码RNA的一个子集。更重要的是,这些RNA位点高度富集CpG岛,”研究报告的*作者Athanasios Zovoilis说。 CpG岛是含有胞嘧啶和*的高频基因组区域。这些岛出现RNA,表明他们可能参与DNA甲基化过程和疾病的发作,但需要额外的探索实验来证明此关系。
“这是*次发现基因的转录起始位点附近的非编码小分子RNA与疾病有关,”Jones说。“尽管需要更深入的研究,但根据我们的数据,相信这些小的非编码RNA有相当大的潜力作为预测工具用于癌症的诊断。此外,它们还可以帮助我们在表观遗传水平更好地了解底层肿瘤的发生机制,然后采用非编码小分子RNA作为潜在的新药物。“研究人员还注意到,这类小的非编码RNA可能对预测其他类型的癌症或疾病有用。
由癌症基因组图谱项目产生的数据,为病变组织和正常组织提供了大量的可访问测序信息,使本工作成为可能。现在,癌症基因组图谱是现存的非编码小分子RNA的zui大资源之一。
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