PPR 蛋白的 RNA 结合模式与已知的 RNA 结合蛋白均不同。 PPR 蛋白由多个 PPR 重复单元组成,大多数情况下,一个经典的 PPR 重复单元含有35个氨基酸,每一个重复单元可以特异性地识别一个 RNA 碱基,近两年的生物信息学和初步生物化学研究研究显示 PPR 模块与 RNA 序列有特异的对应关系,但其识别机理及识别密码尚不明确。揭示 PPR 蛋白特异识别 RNA 碱基的分子机制对于理解 PPR 蛋白的工作机理以及促进 PPR 蛋白生物技术领域的应用具有重要意义。{试剂酶联网:www.shjgogo.com} ELISA试剂盒相关产品推荐:
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颜宁教授研究组与施一公、朱健康、王佳伟、王宏伟等课题组合作,选择源自玉米叶绿体的 PPR10 蛋白进行了深入的结构生物学和生物化学分析,zui终获得了 PPR10 蛋白在未结合 RNA 和特异结合靶标PSAJ单链 RNA 两种状态下的高分辨率晶体结构。结构显示, PPR10 包含19个 PPR 重复单元,每个 PPR 重复单元均为helix-loop-helix结构,多个重复单元组成两圈右手超螺旋。 PPR10 -PSAJ的复合体晶体结构则清晰地揭示了 PPR 蛋白特异性识别 RNA 碱基的分子机理。特异识别发生于 PPR 重复单元的第2、5、35位的氨基酸与相对应的 RNA 碱基,这一结构生物学发现为破解 PPR 的 RNA 识别密码提供了直接的依据。
自然界中有许多具有重复单元构造的蛋白质,其结构与功能的揭示往往可以把这些蛋白质改造为重要的工具蛋白。例如科学家根据 TALE 蛋白对 DNA 序列的特异识别,设计组装能够识别任意序列双链 DNA 的 TALE N工具酶,进而对基因组进行改造。 TALE N已经在多个物种中获得了广泛应用。这是颜宁课题组与合作者继 2012 年 1 月在《科学》报道 TALE 蛋白识别双链 DNA 的分子机制后,对重复单元蛋白的又一项结构与功能研究,希望可以促进 PPR 在生物技术中的应用。
上海同步辐射光源(SSRF)何建华研究员及郁峰博士为数据收集提供了及时有效的帮助,保证了研究组在这一课题上取得突破。南开大学龙加福研究组为 PPR 蛋白的生化性质鉴定提供了重要支持。
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