实验原理
碱裂解法提取质粒是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离它们。在pH值介于12.0~12.5这个狭窄的范围内,线性的DNA双螺旋结构解开而被变性,尽管在这样的条件下,共价闭环质粒DNA的氢键会被断裂,但两条互补链彼此相互盘绕,仍会紧密地结合在一起。当加入pH4.8的乙酸钾高盐缓冲液恢复Ph至中性时,共价闭合环状质粒DNA的两条互补链仍保持在一起,因此复性迅速而准确,在而线性的染色体DNA的两条互补链彼此已*分开,复性就不会那么迅速而准确,它们缠绕形成网状结构,通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA、蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。
实验材料
1.葡萄糖 2.三羟甲基氨基甲烷(Tris)
3.乙二胺四乙酸(EDTA) 4.氢氧化钠
5.十二烷基硫酸钠(SDS) 6.乙酸钾
7.冰乙酸 8.氯仿
9.乙醇 10.胰RNA酶
11.氨苄* 12.蔗糖
13.溴酚蓝 14.酚
15.β巯基乙醇 16.盐酸
17.含pUC18质粒的大肠杆菌
实验步骤
提取质粒
1.将2ml含相应抗生素的LB液体培养基加入到试管中,接入含质粒的大肠杆菌,37℃振荡培养过夜。
2.取1.5ml培养物倒入微量离心管中,4000rpm,离心2min。
3.吸去培养液,使细胞沉淀尽可能干燥。
4.将细菌沉淀悬浮于100μl溶液Ⅰ中,充分混匀,室温放置10 min。
5.加200μl溶液Ⅱ(新鲜配制),混匀内容物,将离心管放冰上5 min。
6.加入150μl溶液Ⅲ(冰上预冷),盖紧管口,颠倒数次使混匀。
7.1200rpm,离心15 min,将上清转至另一离心管中。
8.向上清中加入等体积酚:氯仿(去蛋白),反复混匀,12000rpm,离心5min,将上清转移到另一离心管中.
9.向上清加入2倍体积乙醇,混匀后,室温放置5-10min。12000rpm离心5min。倒去上清液,把离心管倒扣在吸水纸上,吸干液体。
10.用1ml70%乙醇洗涤质粒DNA沉淀,振荡并离心,倒去上清液,真空抽干或空气中干燥。
11.加50μl TE缓冲液,其中含有20μg/ml的胰RNA酶,使DNA*溶解,-20℃保存。
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