佛山市药物结构确认及杂质分析-中科院CMA

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佛山市药物结构确认及杂质分析-中科院CMA

MRM 技术在蛋白质与RNA 相互作用研究中的应用蛋白质- R N A 复合物在调控真核细胞的基因表达上具有重要意义。基于M S 的方法研究蛋白质与R N A 的相互作用多有报道，而采用M R M 与其他技术相结合的方法，能更深入地研究蛋白质与RNA 作用的结构域，得到更丰富的相互作用结构信息。其原理是：通过母离子扫描的模式，获得含有磷酸碎片的所有多肽离子的准确分子量和电荷数。设计MRM 离子对，母离子扫描获得的信号离子作为母离子，子离子设定为碱基序列AUGC ，在MRM 的检测域值达到设定值后，进行高分辨增强子离子扫描, 终获取蛋白质序列信息和与其作用的R N A 序列信息。Lenz 等[17]采用此方法，研究了U1SnRNP 和1515K-61K-U4atacSnRN 与RNA 的相互作用信息，分别用*和R N A 酶T 1、A 对蛋白质和R N A 进行酶切，得到相互作用的短肽段和RNA 的短序列，在负离子模式进行母离子扫描，依据获得的结果设计MRM 母- 子离子对，在正离子模式进行MRM-子离子增强扫描，后得到了相互作用结构域等更为详细的信息。

2、碳（¹³C）谱、DEPT谱

扫描谱宽249.0716Hz (250 ppm)，打印谱宽20551.725Hz (215ppm)。

DEPT谱辅助碳谱解析如下：δ 22.20为3位、4位的CH₂ 碳峰，δ 50.28为5位（或7位）的CH₂ 碳峰，δ 50.51为7位（或5位）的CH₂ 碳峰，δ 23.57为1'位的CH₃碳峰, 1位和2位的CH碳峰（δ 39.63）藏在DMSO溶剂峰中，δ74.13为2'位的CH碳峰，δ 192.27为3'位的羰碳峰。数据见附表2。

2、碳（¹³C）谱、DEPT谱

扫描谱宽249.0716Hz (250 ppm)，打印谱宽20551.725Hz (215ppm)。

DEPT谱辅助碳谱解析如下：δ 22.20为3位、4位的CH₂ 碳峰，δ 50.28为5位（或7位）的CH₂ 碳峰，δ 50.51为7位（或5位）的CH₂ 碳峰，δ 23.57为1'位的CH₃碳峰, 1位和2位的CH碳峰（δ 39.63）藏在DMSO溶剂峰中，δ74.13为2'位的CH碳峰，δ 192.27为3'位的羰碳峰。数据见附表2。

2、碳（¹³C）谱、DEPT谱

扫描谱宽249.0716Hz (250 ppm)，打印谱宽20551.725Hz (215ppm)。

DEPT谱辅助碳谱解析如下：δ 22.20为3位、4位的CH₂ 碳峰，δ 50.28为5位（或7位）的CH₂ 碳峰，δ 50.51为7位（或5位）的CH₂ 碳峰，δ 23.57为1'位的CH₃碳峰, 1位和2位的CH碳峰（δ 39.63）藏在DMSO溶剂峰中，δ74.13为2'位的CH碳峰，δ 192.27为3'位的羰碳峰。数据见附表2。

仪器名称及型号：超导脉冲付里叶变换核磁共振谱仪

                德国 Bruker  DRX-400

溶剂：CDCl₃