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蛋白胨分子的测量是一个非常缜密的过程，尤其是测量大豆蛋白胨时一旦某一个地方出现错误就导致测量必须从头再来，下面我们就简述一下测量的过程。
首先将电泳槽进行安装，干燥的两块玻璃板装入配套塑料夹套内，垂直固定在电泳槽上，周边用百分之一点五的琼脂密封；然后就是要样品处理了，将各种标准蛋白胨和待测样品分别溶于浓度为2mg/ml的蛋白胨处理液中，在沸水中加热3到4分钟，待冷却后作点样用；zui后也就是zui重要的一步是制胶选择合适的胶浓度按下表配制百分之七点五的分离胶，混合后将其沿长玻璃板加入两块玻璃板之间，千万要注意玻璃板之间不要产生气泡，加到距短玻璃板上边缘三厘米处，立即复盖二到三毫升的水层，静止聚合约四十分钟左右。蛋白胨胶聚合好的标志是胶与水之间形成清晰的界面。吸取分离胶的水分，将配制好的浓缩胶注入分离胶之上，立即插上有机玻璃的点样槽模板，待蛋白胨浓缩胶聚合好备用。
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