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质粒DNA的制备
有多种分离质粒的方法,如碱裂解法、煮沸裂解法、层析柱过滤法等。
目前一般使用碱变性法制备质粒DNA。这个方法主要包括培养收集细菌菌体,裂解细胞,将质粒DNA与染色体DNA分开及除去蛋白质和RNA。
1.碱变性法质粒提取的原理:
根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA片断之间,在拓扑学上的差异而发展出来的。
在pH值12.0~12.5范围内时,线性的DNA会被变性而共价闭合环状质粒DNA却不会被变性。
通过冷却或恢复中性pH值使之复性,线性染色体形成网状结构,而cccDNA可以准确迅速复性,通过离心去除线性染色体,获得含有cccDNA的上清液,zui后用乙醇沉淀,获得质粒DNA。
2.碱变性法提取质粒的步骤:
(1)取1.5毫升含质粒的大肠杆菌过夜培养物,加在微量离心管中,离心收集细胞沉淀;
(2)加入100微升冰冷的溶液I,(50mM葡萄糖, 25mM Tris-HCl PH=8.0, 10mM EDTA)涡旋震荡悬浮菌液。
(3)加入200微升新配制的溶液II,(0.2M NaOH,1.0%SDS)缓缓混匀置室温5分钟。
(4)加入150毫升冰冷的溶液III,(*29.4克,冰乙酸11.5毫升,加蒸馏水至100毫升)颠倒离心管10次后,冰浴5分钟。
(5)离心的上清液用*抽提数次,用乙醇沉淀收集质粒DNA。细胞
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